Zスタック共焦点画像の血管様構造の3D定量化

光学スライス顕微鏡は、一般に、in vitro血管新生などの3D細胞培養の形態計測的特徴を特徴付けるために使用されます。ただし、これらの構造の定量分析は、多くの場合、単一の2D最大強度投影画像で実行され、3D培養から得られたデータの精度を制限します。ここでは、Zスタック画像の定量分析のためのプロトコルを提示し、Fiji、Amira、およびWinFiber3Dを利用します。このプロトコルは、3D細胞培養モデル内の血管様構造の詳細な検査を促進します。このプロトコルの使用と実行の詳細については、Koch et alを参照してください。（2020）。

Optical slice microscopy is commonly used to characterize the morphometric features of 3D cellular cultures, such as in vitro vascularization. However, the quantitative analysis of those structures is often performed on a single 2D maximum intensity projection image, limiting the accuracy of data obtained from 3D cultures. Here, we present a protocol for the quantitative analysis of z stack images, utilizing Fiji, Amira, and WinFiber3D. This protocol facilitates the in-depth examination of vascular-like structures within 3D cell culture models. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Koch et al. (2020).