著名医師による解説が無料で読めます
すると翻訳の精度が向上します
目的：プラチナベースの化学療法は、上皮卵巣癌（EOC）に広く使用されています。EOC患者の20〜25％が初期の化学療法に反応しません。蓄積された証拠は、DNAメチル化が化学療法耐性表現型スクリーニングの潜在的なバイオマーカーとして機能する可能性があることを暗示しています。ただし、原発プラチナ抵抗の根底にあるパターンは不明のままです。 方法：表現ビスル酸塩シーケンスの低下（RRBS）分析を実施して、原発性プラチナ耐性患者の進行性生存（PFS）（PFS <6ヶ月、n = 8）と極度の敏感な患者（PFS≥24か月、n = 8）のメチル化状態の違いを特定するために実行されました。Qubit 3.0蛍光計は、RRBSライブラリの定量化に使用されました。RRBSライブラリは、50 bpペアエンドリードとしてイルミナHisq2500シーケンサーでシーケンスされました。 結果：スクリーニング後、94の有効なハイパー/ハイポメチル化領域が94の遺伝子プロモーターおよびエクソン領域（調整されたQ≤0.5）内に位置することが確認されました。TRC-GCA11-1、LOC105370912、ANO7P1、DHX4、MSH2、CDCP2、CCNL1、ARHGAP42P2、PRDM13、LOC101928344、USP29、ZIC5、ZIC5、IL1のABR1、IL1rapl1、EvclslのARHGAP42P2、ARHGAP42PP2、ABRN1、を含むプロモーター領域に位置する19の差異メチル化領域（DMR）UBALD1、LINC00261、およびISL2は、MSH2、LINC00261、MGRN1、ZIC5、EVX2、CCNL1、およびDHX40の低値から高へのp値に従って同定されました。 結論：RRBSアッセイに基づくDNAメチロームプロファイリングは、原発性白金耐性患者の異常にメチル化された遺伝子をスクリーニングするための効果的な方法であり、原発性白金耐性の予測の潜在的なエピジェネティックなバイオマーカーとして機能する可能性があります。
目的：プラチナベースの化学療法は、上皮卵巣癌（EOC）に広く使用されています。EOC患者の20〜25％が初期の化学療法に反応しません。蓄積された証拠は、DNAメチル化が化学療法耐性表現型スクリーニングの潜在的なバイオマーカーとして機能する可能性があることを暗示しています。ただし、原発プラチナ抵抗の根底にあるパターンは不明のままです。 方法：表現ビスル酸塩シーケンスの低下（RRBS）分析を実施して、原発性プラチナ耐性患者の進行性生存（PFS）（PFS <6ヶ月、n = 8）と極度の敏感な患者（PFS≥24か月、n = 8）のメチル化状態の違いを特定するために実行されました。Qubit 3.0蛍光計は、RRBSライブラリの定量化に使用されました。RRBSライブラリは、50 bpペアエンドリードとしてイルミナHisq2500シーケンサーでシーケンスされました。 結果：スクリーニング後、94の有効なハイパー/ハイポメチル化領域が94の遺伝子プロモーターおよびエクソン領域（調整されたQ≤0.5）内に位置することが確認されました。TRC-GCA11-1、LOC105370912、ANO7P1、DHX4、MSH2、CDCP2、CCNL1、ARHGAP42P2、PRDM13、LOC101928344、USP29、ZIC5、ZIC5、IL1のABR1、IL1rapl1、EvclslのARHGAP42P2、ARHGAP42PP2、ABRN1、を含むプロモーター領域に位置する19の差異メチル化領域（DMR）UBALD1、LINC00261、およびISL2は、MSH2、LINC00261、MGRN1、ZIC5、EVX2、CCNL1、およびDHX40の低値から高へのp値に従って同定されました。 結論：RRBSアッセイに基づくDNAメチロームプロファイリングは、原発性白金耐性患者の異常にメチル化された遺伝子をスクリーニングするための効果的な方法であり、原発性白金耐性の予測の潜在的なエピジェネティックなバイオマーカーとして機能する可能性があります。
AIM: Platinum-based chemotherapy is widely used for epithelial ovarian cancer (EOC). As high as 20-25% of EOC patients will not respond to the initial chemotherapy. Accumulated evidences have implied that DNA methylation may serve as a potential bio-marker for chemotherapy-resistant phenotypic screening; however, the pattern underlying primary platinum resistance remains unclear. METHODS: Reduced representation bisulfite sequencing (RRBS) analysis was performed to identify differences in methylation status between primary platinum-resistant patients Progression free survival (PFS) (PFS < 6 months, n = 8) and extreme sensitive patients (PFS ≥ 24 months, n = 8). The Qubit 3.0 Fluorometer was used for the quantification of RRBS library. The RRBS library was sequenced on Illumina HiSeq2500 sequencer as 50 bp paired-end reads. RESULTS: After screening, 94 valid hyper-/hypo-methylated regions were identified to be located within 94 gene promoter and exon regions (adjusted q ≤ 0.5), which were primarily associated with cell-cell adhesion, B cell activation and lymphocyte activation according to GO analysis. The 19 differentially methylated regions (DMR) located in the promoter region including TRC-GCA11-1, LOC105370912, ANO7P1, DHX4,MSH2, CDCP2, CCNL1, ARHGAP42P2, PRDM13, LOC101928344, USP29, ZIC5,IL1RAPL1, EVX2, ABR, MGRN1, UBALD1, LINC00261, and ISL2 were identified according to the order of P-values from low to high, of which MSH2, LINC00261, MGRN1, ZIC5, EVX2, CCNL1, and DHX40 were presented to play a variety of roles in cancers process based on the previous studies. CONCLUSION: DNA methylome profiling based on RRBS assay is an effective method for screening aberrantly methylated genes in primary platinum-resistant patients, which may serve as a potential epigenetic bio-marker for the prediction of primary platinum resistance.
医師のための臨床サポートサービス
ヒポクラ x マイナビのご紹介
無料会員登録していただくと、さらに便利で効率的な検索が可能になります。