フランス、マルセイユのホームレス集団における腸内病原性細菌と耐性遺伝子運送

フランスのマルセイユのホームレス人の間で収集された直腸サンプルにおける病原性細菌と耐性遺伝子の有病率を評価することを目指しました。2014年2月に、アンケートに回答し、直腸サンプルを収集した114人の保護されたホームレスの大人を登録しました。直腸サンプルで直接実行されたリアルタイムポリメラーゼ連鎖反応（QPCR）によって、8種類の腸内細菌と15の抗生物質耐性遺伝子（ARGS）が求められました。動物陽性サンプルは、従来のPCRとシーケンスによってさらにテストされました。胃腸症状の17.5％の有病率、大腸菌の病原体大腸菌の病原型（8.7％）およびトロフィアマホイップライ（0.9％）を含む腸内病原性細菌キャリッジの9.6％の有病率を証明しました。BLACTX-M-15耐性遺伝子（1.8％）を運ぶのは2人だけでしたが、カルバペネマーゼをエンコードする遺伝子やコリスチン耐性遺伝子（MCR-1からMCR-6、MCR-8）を含む他の遺伝子は検出されませんでした。我々の結果は、マルセイユの避難したホームレスの人が胃腸抗生物質耐性菌を飼うリスクが高いことを示唆しています。

We aimed to assess the prevalence of pathogenic bacteria and resistance genes in rectal samples collected among homeless persons in Marseille, France. In February 2014 we enrolled 114 sheltered homeless adults who completed questionnaires and had rectal samples collected. Eight types of enteric bacteria and 15 antibiotic resistance genes (ARGs) were sought by real-time polymerase chain reaction (qPCR) performed directly on rectal samples. ARG-positive samples were further tested by conventional PCR and sequencing. We evidenced a 17.5% prevalence of gastrointestinal symptoms, a 9.6% prevalence of enteric pathogenic bacteria carriage, including Escherichia coli pathotypes (8.7%) and Tropheryma whipplei (0.9%). Only 2 persons carried blaCTX-M-15 resistance genes (1.8%), while other genes, including carbapenemase-encoding genes and colistin-resistance genes, (mcr-1 to mcr-6, mcr-8) were not detected. Our results suggest that sheltered homeless persons in Marseille do not have a high risk of harbouring gastrointestinal antibiotic resistant bacteria.