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両生類は、Chytrid菌Batrachochytrium dendrobatidis（BD）によって引き起こされる、Chytridiomycosisと呼ばれる表皮疾患の出現と並行して、近年世界中で衰退しています。この病気は、コスタリカを含む世界中の両生類の大量死亡率と関連しており、BDはこの脊椎動物のグループの消失に重要な貢献者と考えられています。多くの種は病気の影響を受けやすいものの、他の種は寛容を示し、病原体による感染を生き延びました。コスタリカで循環する病原体BDと、in vitroでの病原体の成長を阻害する両生類の皮膚細菌の能力を評価しました。私たちは、両生類の集団が減少している領域からいくつかのBD分離株を、遺伝的および形態学的に分離し、特徴づけました。コスタリカの循環チルトリド菌は、世界中の大規模な両生類の死に関連している毒性株BD-gpl-2に属していると判断しました。しかし、得られた分離株は、遺伝的および形態学的変動を示した。さらに、生存する集団の12個の両生類種から表皮細菌を分離し、一部は絶滅の危険にさらされており、チルトリド分離株の収集に対する阻害活性を評価しました。バイオアッセイを通じて、コスタリカの両生類におけるChytrid阻害細菌属の存在を確認しました。しかし、阻害は同じ細菌属の異なる分離株間で異なることが観察され、各細菌の分離は真菌の分離を異なって阻害することが観察されました。合計で、ステノトロフォモナス属、ストレプトマイセス、エンテロバクター、シュードモナス、クレブシエラ属に属する14の細菌分離株は、すべてのBD分離株に対して阻害活性を示しました。病原体と細菌阻害能力の両方で観察された変動を考えると、局所分離株を含めることが非常に関連しており、チトリジオ環境のための緩和戦略の開発と実施を目的としたin vivo感染テストで行われる際に微生物の起源を考慮することが非常に重要です。
両生類は、Chytrid菌Batrachochytrium dendrobatidis（BD）によって引き起こされる、Chytridiomycosisと呼ばれる表皮疾患の出現と並行して、近年世界中で衰退しています。この病気は、コスタリカを含む世界中の両生類の大量死亡率と関連しており、BDはこの脊椎動物のグループの消失に重要な貢献者と考えられています。多くの種は病気の影響を受けやすいものの、他の種は寛容を示し、病原体による感染を生き延びました。コスタリカで循環する病原体BDと、in vitroでの病原体の成長を阻害する両生類の皮膚細菌の能力を評価しました。私たちは、両生類の集団が減少している領域からいくつかのBD分離株を、遺伝的および形態学的に分離し、特徴づけました。コスタリカの循環チルトリド菌は、世界中の大規模な両生類の死に関連している毒性株BD-gpl-2に属していると判断しました。しかし、得られた分離株は、遺伝的および形態学的変動を示した。さらに、生存する集団の12個の両生類種から表皮細菌を分離し、一部は絶滅の危険にさらされており、チルトリド分離株の収集に対する阻害活性を評価しました。バイオアッセイを通じて、コスタリカの両生類におけるChytrid阻害細菌属の存在を確認しました。しかし、阻害は同じ細菌属の異なる分離株間で異なることが観察され、各細菌の分離は真菌の分離を異なって阻害することが観察されました。合計で、ステノトロフォモナス属、ストレプトマイセス、エンテロバクター、シュードモナス、クレブシエラ属に属する14の細菌分離株は、すべてのBD分離株に対して阻害活性を示しました。病原体と細菌阻害能力の両方で観察された変動を考えると、局所分離株を含めることが非常に関連しており、チトリジオ環境のための緩和戦略の開発と実施を目的としたin vivo感染テストで行われる際に微生物の起源を考慮することが非常に重要です。
Amphibians have declined around the world in recent years, in parallel with the emergence of an epidermal disease called chytridiomycosis, caused by the chytrid fungus Batrachochytrium dendrobatidis (Bd). This disease has been associated with mass mortality in amphibians worldwide, including in Costa Rica, and Bd is considered an important contributor to the disappearance of this group of vertebrates. While many species are susceptible to the disease, others show tolerance and manage to survive infection with the pathogen. We evaluated the pathogen Bd circulating in Costa Rica and the capacity of amphibian skin bacteria to inhibit the growth of the pathogen in vitro. We isolated and characterized - genetically and morphologically - several Bd isolates from areas with declining populations of amphibians. We determined that the circulating chytrid fungus in Costa Rica belongs to the virulent strain Bd-GPL-2, which has been related to massive amphibian deaths worldwide; however, the isolates obtained showed genetic and morphological variation. Furthermore, we isolated epidermal bacteria from 12 amphibian species of surviving populations, some in danger of extinction, and evaluated their inhibitory activity against the collection of chytrid isolates. Through bioassays we confirmed the presence of chytrid-inhibitory bacterial genera in Costa Rican amphibians. However, we observed that the inhibition varied between different isolates of the same bacterial genus, and each bacterial isolation inhibited fungal isolation differently. In total, 14 bacterial isolates belonging to the genera Stenotrophomonas, Streptomyces, Enterobacter, Pseudomonas and Klebsiella showed inhibitory activity against all Bd isolates. Given the observed variation both in the pathogen and in the bacterial inhibition capacity, it is highly relevant to include local isolates and to consider the origin of the microorganisms when performing in vivo infection tests aimed at developing and implementing mitigation strategies for chytridiomycosis.
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