Klebsiellaby LC-MS/MSおよびSalkowskiメソッドにおけるインドール-3-酢酸（IAA）産生の分析

植物の根圏から分離された多くの根圏細胞は、二次代謝産物の形でさまざまな植物ホルモンを生成し、その最も一般的なのはインドール-3-酢酸（IAA）です。ここでは、Dianthus caryophyllusの根圏から分離されたリゾバクテリウム（グローブ全体の商業的に重要な花）から分離されたrhizobacteriumであるKlebsiella sgm 81に最近適用されたように、in vitroおよびin inituのIAA検出と定量化の分析プロトコルを詳しく説明します。具体的には、インドール化合物の存在をスクリーニングするために使用できるSalkowski試薬法を使用した比色アッセイの詳細なプロトコルについて説明します。IAAをさらに検出および定量化するために、LC-MS/MSの非常に正確な分析アプローチが使用されます。Dianthus caryophyllusの根系の周りのIAAの存在を検出するために、植物の根のその場染色は、Salkowski試薬を使用して行われます。

Many rhizobacteria isolated from plant rhizosphere produce various phytohormones in the form of secondary metabolites, the most common of which is Indole-3-acetic acid (IAA). Here, we detail analytical protocols of IAA detection and quantification, in vitro and in situ, as recently applied to Klebsiella SGM 81, a rhizobacterium isolated from the rhizosphere of Dianthus caryophyllus (a commercially important flower across the globe). Specifically, we describe a detailed protocol for a colorimetric assay using the Salkowski reagent method, which can be used to screen for the presence of Indole compounds. To further detect and quantify IAA, a highly accurate analytical approach of LC-MS/MS is used. To detect the presence of IAA around the root system of Dianthus caryophyllus, in situ staining of plant roots is done using Salkowski reagent.