胸腺癌における突然変異プロファイルと免疫鏡署名：探索的研究と文献のレビュー

背景：胸腺発がんに関与する分子経路を調査するために多大な努力が払われています。しかし、遺伝的所見はまだ臨床診療に影響を与えていません。この探索的試験の目的は、一連の胸腺癌（TCS）の免疫鏡と分子プロファイルを評価し、このデータを臨床結果と相関させることでした。 方法：ホルマリン固定のパラフィン包埋（FFPE）TC組織をセンターアーカイブから回収しました。免疫鏡は、エンジェルとガロンに従って評価されました。DNAは、FFPE腫瘍サンプルから抽出され、利用可能な場合は、隣接する組織学的に正常組織から抽出されました。次世代シーケンス（NGS）が実行され、50個の癌遺伝子と腫瘍抑制遺伝子のホットスポット領域を標的としました。 結果：一連の15 TCを分析しました。82.4か月の追跡期間の中央値の後、全生存期間の中央値は104.7か月でした。免疫鏡は5/15人の患者で2人以上でした（33％）。調査した遺伝子の中で、5/15患者（33％）で変異の欠如が観察されましたが、1/15（6％）の患者、4/15患者（26％）の患者、5人に1人のバリアントで3つのバリアントが観察されました。/15人の患者（33％）が見つかりました。最も繰り返される変異遺伝子は、FGFR3（5つの変異）とCDKN2A（3つの変異、そのうち2つはナンセンスでした）でした。CDKN2A損失の患者は、統計的に有意に悪化した生存率を示したが（P = 0.0013）、FGFR3変異の患者は統計的に有意に優れた生存率を示した（P = 0.048）。 結論：この研究では、TCSの突然変異景観に関するいくつかの既存のレポートにデータを追加し、これまでの最初の包括的な分析を提供します。ここでは、TCSの変異の低い割合を確認し、興味深い潜在的な治療標的としてFGFR3およびCDKN2A変異を示唆しています。

BACKGROUND: Significant efforts have been made to investigate the molecular pathways involved in thymic carcinogenesis. However, genetic findings have still not impacted clinical practice. The aim of this exploratory trial was to evaluate the immunoscore and molecular profile of a series of thymic carcinomas (TCs), correlating this data with clinical outcome. METHODS: Formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) TC tissues were retrieved from our center archive. The immunoscore was evaluated according to Angell and Gallon. DNA was extracted from FFPE tumor samples and, when available, from adjacent histologically normal tissues. Next-generation sequencing (NGS) was performed targeting hotspot regions of 50 oncogenes and tumor suppressor genes. RESULTS: A series of 15 TCs were analyzed. After a median follow-up of 82.4 months, the median overall survival was 104.7 months. The immunoscore was >2 in 5/15 patients (33%). Among the investigated genes, absence of mutations was observed in 5/15 patients (33%), whereas three variants in 1/15 (6%) patient, two variants in 4/15 (26%) patients, and one variant in 5/15 patients (33%) were found. The most recurrently mutated genes were FGFR3 (five mutations) and CDKN2A (three mutations, two of which were nonsense). Patients with CDKN2A loss showed a statistically significantly worse survival (P = 0.0013), whereas patients with FGFR3 mutations showed a statistically significantly better survival (P = 0.048). CONCLUSIONS: This study adds data to the few existing reports on the mutational landscape of TCs, providing the first comprehensive analysis to date. Here, we confirm the low rate of mutations in TCs and suggest FGFR3 and CDKN2A mutations as intriguing potential therapeutic targets.