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背景：パラコクシジオイド症（PCM）は、主にブラジルのラテンアメリカでの全身性および風土病の真菌感染症です。PCM症例の大部分は、南、南東、中西部の地域で構成されるブラジルの広い地域で発生し、後者はParacoccidioides lutzii種の発生率が高いことを示しています。 方法論と主な調査結果：この研究では、ブラジルの中西部地域にあるMato Grosso do Sulの2016年から2019年の13の新しいPCM症例の臨床、分子、および血清学的データを提示します。これらの13症例から、16の臨床分離株が得られ、そのゲノムDNAはTub1 -PCR -RFLPによる遺伝子型にさらされました。結果は、パラコッシジオイドbrasiliensis sensu stricto（S1）（11/16; 68.8％）、paracoccidioides restrepiensis（PS3）（4/16; 25.0％）およびP. lutzii（1/16; 6.2％）としてパラコッキディオード種として示されました。したがって、状態で循環している系統発生種の種類が血清学的検査の反応性プロファイルに影響するかどうかを理解するために、この一連のPCM症例に見られる遺伝子型株からのエクサ抗原を使用して、二重寒天ゲル免疫拡散（DID）を実行しました。全体として、DIDテストは、確認されたPCM症例の約30％で偽陰性でした。すべての患者は男性で、ほとんどが現在または以前の農村部の活動があり、年齢は17歳から59歳で、40歳以上の患者11人（84.6％）がありました。パラコッシジオイド種の間に臨床的または疫学的な違いは見られませんでした。ただし、P。lutziiの唯一のケースは結果として死亡したことに注意することが重要です。 結論：この研究は、P。brasiliensissensu stricto（S1）が主要な種として示唆しており、ブラジルでの幅広い地理的分布を示しています。さらに、私たちの調査結果は、ブラジルのマト・グロッソ・ド・スールの状態でのP. rextrepiensis（PS3）の発生を初めて明らかにしました。私たちのset折にもかかわらず、提示された分子情報を補完するために、これらの臨床分離株の完全なシーケンスを提供することは興味深いでしょう。
背景：パラコクシジオイド症（PCM）は、主にブラジルのラテンアメリカでの全身性および風土病の真菌感染症です。PCM症例の大部分は、南、南東、中西部の地域で構成されるブラジルの広い地域で発生し、後者はParacoccidioides lutzii種の発生率が高いことを示しています。 方法論と主な調査結果：この研究では、ブラジルの中西部地域にあるMato Grosso do Sulの2016年から2019年の13の新しいPCM症例の臨床、分子、および血清学的データを提示します。これらの13症例から、16の臨床分離株が得られ、そのゲノムDNAはTub1 -PCR -RFLPによる遺伝子型にさらされました。結果は、パラコッシジオイドbrasiliensis sensu stricto（S1）（11/16; 68.8％）、paracoccidioides restrepiensis（PS3）（4/16; 25.0％）およびP. lutzii（1/16; 6.2％）としてパラコッキディオード種として示されました。したがって、状態で循環している系統発生種の種類が血清学的検査の反応性プロファイルに影響するかどうかを理解するために、この一連のPCM症例に見られる遺伝子型株からのエクサ抗原を使用して、二重寒天ゲル免疫拡散（DID）を実行しました。全体として、DIDテストは、確認されたPCM症例の約30％で偽陰性でした。すべての患者は男性で、ほとんどが現在または以前の農村部の活動があり、年齢は17歳から59歳で、40歳以上の患者11人（84.6％）がありました。パラコッシジオイド種の間に臨床的または疫学的な違いは見られませんでした。ただし、P。lutziiの唯一のケースは結果として死亡したことに注意することが重要です。 結論：この研究は、P。brasiliensissensu stricto（S1）が主要な種として示唆しており、ブラジルでの幅広い地理的分布を示しています。さらに、私たちの調査結果は、ブラジルのマト・グロッソ・ド・スールの状態でのP. rextrepiensis（PS3）の発生を初めて明らかにしました。私たちのset折にもかかわらず、提示された分子情報を補完するために、これらの臨床分離株の完全なシーケンスを提供することは興味深いでしょう。
BACKGROUND: Paracoccidioidomycosis (PCM) is a systemic and endemic fungal infection in Latin American, mainly in Brazil. The majority of PCM cases occur in large areas in Brazil, comprising the South, Southeast and Midwest regions, with the latter demonstrating a higher incidence of the species Paracoccidioides lutzii. METHODOLOGY AND MAIN FINDINGS: This study presents clinical, molecular and serological data of thirteen new PCM cases during 2016 to 2019 from the state of Mato Grosso do Sul, located in the Midwest region, Brazil. From these thirteen cases, sixteen clinical isolates were obtained and their genomic DNAs were subjected to genotyping by tub1 -PCR-RFLP. Results showed Paracoccidioides brasiliensis sensu stricto (S1) (11/16; 68.8%), Paracoccidioides restrepiensis (PS3) (4/16; 25.0%) and P. lutzii (1/16; 6.2%) as Paracoccidiodes species. Therefore, in order to understand whether the type of phylogenetic species that are circulating in the state influence the reactivity profile of serological tests, we performed double agar gel immunodiffusion (DID), using exoantigens from genotyped strains found in this series of PCM cases. Overall, our DID tests have been false negative in about 30% of confirmed PCM cases. All patients were male, most with current or previous rural activity, with ages ranging from 17 to 59 years, with 11 patients (84.6%) over 40 years of age. No clinical or epidemiological differences were found between Paracoccidioides species. However, it is important to note that the only case of P. lutzii died as an outcome. CONCLUSIONS: This study suggests P. brasiliensis sensu stricto (S1) as the predominant species, showing its wide geographic distribution in Brazil. Furthermore, our findings revealed, for the first time, the occurrence of P. restrepiensis (PS3) in the state of Mato Grosso do Sul, Brazil. Despite our setbacks, it would be interesting to provide the complete sequencing of these clinical isolates to complement the molecular information presented.
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