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腫瘍性IGF2 mRNA結合タンパク質1（IGF2BP1）は、さまざまな固形腫瘍の腫瘍の進行を促進し、その発現は不利な予後に関連しています。癌細胞でIGF2BP1に提案されている主な役割は、腫瘍形成因子をコードするmRNAの安定化です。しかし、いくつかのIGF2BP1-RNA関連の研究により、多くの推定IGF2BP1-RNA標的が明らかになりました。したがって、現在、がんのIGF2BP1によって制御される主な保存された標的RNAと経路は、とらえどころのないままです。この研究では、癌細胞株におけるIGF2BP1発現の依存における保存された規制緩和のパターンを示す一連の遺伝子と癌の特徴経路を提示します。これらの発見の統合分析により、公的に利用可能な癌トランスクリプトームおよびIGF2BP1-RNA関連データによる分析により、一連の主要候補ターゲットmRNAを編集しました。これらの分析は、がん細胞周期の進行を制御する際のIGF2BP1の極めて重要な役割を裏付け、IGF2BP1の影響を受けた新規癌の特徴経路を明らかにします。これらの研究で特定された3つの新しいターゲットmRNA、すなわちアウルカ、HDLBP、YWHAZについて、IGF2BP1 mRNA安定化を確認します。要するに、私たちの調査結果は、主に3'utr、m6a-、miRNA-、および潜在的にauに富む要素依存的な方法で標的mRNAを安定化することにより、発癌性遺伝子発現を促進する際のIGF2BP1の極めて重要な役割に関する以前の調査結果を確認および拡大します。
腫瘍性IGF2 mRNA結合タンパク質1（IGF2BP1）は、さまざまな固形腫瘍の腫瘍の進行を促進し、その発現は不利な予後に関連しています。癌細胞でIGF2BP1に提案されている主な役割は、腫瘍形成因子をコードするmRNAの安定化です。しかし、いくつかのIGF2BP1-RNA関連の研究により、多くの推定IGF2BP1-RNA標的が明らかになりました。したがって、現在、がんのIGF2BP1によって制御される主な保存された標的RNAと経路は、とらえどころのないままです。この研究では、癌細胞株におけるIGF2BP1発現の依存における保存された規制緩和のパターンを示す一連の遺伝子と癌の特徴経路を提示します。これらの発見の統合分析により、公的に利用可能な癌トランスクリプトームおよびIGF2BP1-RNA関連データによる分析により、一連の主要候補ターゲットmRNAを編集しました。これらの分析は、がん細胞周期の進行を制御する際のIGF2BP1の極めて重要な役割を裏付け、IGF2BP1の影響を受けた新規癌の特徴経路を明らかにします。これらの研究で特定された3つの新しいターゲットmRNA、すなわちアウルカ、HDLBP、YWHAZについて、IGF2BP1 mRNA安定化を確認します。要するに、私たちの調査結果は、主に3'utr、m6a-、miRNA-、および潜在的にauに富む要素依存的な方法で標的mRNAを安定化することにより、発癌性遺伝子発現を促進する際のIGF2BP1の極めて重要な役割に関する以前の調査結果を確認および拡大します。
The oncofetal IGF2 mRNA-binding protein 1 (IGF2BP1) promotes tumor progression in a variety of solid tumors and its expression is associated with adverse prognosis. The main role proposed for IGF2BP1 in cancer cells is the stabilization of mRNAs encoding pro-oncogenic factors. Several IGF2BP1-RNA association studies, however, revealed a plethora of putative IGF2BP1-RNA targets. Thus, at present the main conserved target RNAs and pathways controlled by IGF2BP1 in cancer remain elusive. In this study, we present a set of genes and cancer hallmark pathways showing a conserved pattern of deregulation in dependence of IGF2BP1 expression in cancer cell lines. By the integrative analysis of these findings with publicly available cancer transcriptome and IGF2BP1-RNA association data, we compiled a set of prime candidate target mRNAs. These analyses confirm a pivotal role of IGF2BP1 in controlling cancer cell cycle progression and reveal novel cancer hallmark pathways influenced by IGF2BP1. For three novel target mRNAs identified by these studies, namely AURKA, HDLBP and YWHAZ, we confirm IGF2BP1 mRNA stabilization. In sum our findings confirm and expand previous findings on the pivotal role of IGF2BP1 in promoting oncogenic gene expression by stabilizing target mRNAs in a mainly 3'UTR, m6A-, miRNA-, and potentially AU-rich element dependent manner.
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