HLA遺伝子型と南アジア人のCovid-19感染の重症度との関連

地域の変動は、Covid-19感染の発生率と重症度に見られます。ヒト白血球抗原（HLA）多型は、疾患の結果に影響を与える可能性のある遺伝的要因の1つです。この研究では、南アジアの患者におけるHLA遺伝子型とCovid-19の重症度との関連を調査しました。Covid-19を含む95人のアジア人（バングラデシュ、インディアン、パキスタン人）の血液サンプルが収集されました。患者は、感染の重症度に応じて分割されました：軽度（n = 64）、重度（n = 31）、および致命的（n = 20）。すべてのサンプルからDNAを抽出し、PCR-RSSO（ポリメラーゼ連鎖反応反応配列特異的オリゴヌクレオチド）分子法を使用して、クラスI（A、B、およびC）とクラスII（DRB1、DQA1、およびDQB1）の両方に対してHLAジェノタイピングを実施しました。HLA-B*51の頻度は、致命的なグループの患者の方が軽度の感染群の患者よりも有意に高かった（15％対4.7％、P = 0.027）。さらに、HLA-B*35の頻度は、致命的なグループよりも軽度の感染群で有意に高かった（21.1％対7.5％、P = 0.050 [境界P値]）。HLAクラスIIに関しては、DRB1*13が軽度の感染症グループよりも致命的なグループで有意に観察されました（17.5％対11.3％、P = 0.049）。ただし、すべての対立遺伝子のp値は、p値（PC = 0.216、PC = 0.4、およびPC = 0.49）の統計的修正の後に重要ではありませんでした。公開されたすべてのデータと比較して、この研究は、HLAシステムとCovid-19の結果との関連が民族依存性である可能性があることを強調しています。感染の予後とワクチンの有効性を評価するために、集団間の遺伝的変異をより広い規模で調べる必要があります。

Regional variations are found in the incidence and severity of the COVID-19 infection. Human leukocyte antigen (HLA) polymorphism is one of the genetic factors that might have an impact on the outcome of the disease. This study explored the association between the HLA genotype and the severity of COVID-19 among patients from South Asia. Blood samples from 95 Asians (Bangladeshis, Indians, and Pakistanis) with COVID-19 were collected. The patients were divided according to the severity of their infection: mild (N = 64), severe (N = 31), and fatal (N = 20). DNA was extracted from all samples, and HLA genotyping was performed for both class I (A, B, and C) and class II (DRB1, DQA1, and DQB1) using the PCR-rSSO (polymerase chain reaction-reverse sequence-specific oligonucleotide) molecular method. The frequency of HLA-B*51 was significantly higher among patients in the fatal group than among those in the mild infection group (15% vs. 4.7%, p = 0.027). Additionally, the frequency of HLA-B*35 was significantly higher in the mild infection group than in the fatal group (21.1% vs. 7.5%, p = 0.050 [a borderline p-value]). In terms of HLA class II, DRB1*13 was significantly observed in the fatal group than in the mild infection group (17.5% vs. 11.3%, p = 0.049). However, the p-value for all alleles became insignificant after a statistical correction for the p-values (pc  = 0.216, pc  = 0.4, and pc  = 0.49, respectively). Compared with all published data, this study highlights that the association between the HLA system and the COVID-19 outcome might be ethnic-dependent. Genetic variation between populations must be examined on a wider scale to assess infection prognosis and vaccine effectiveness.