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マクロファージの古典的なM1/M2極性は、肺の複雑な微小環境とマクロファージの可塑性による慢性閉塞性肺疾患(COPD)を含む炎症性肺疾患には適用できない場合があります。CD40(M1マーカー)とCD163(M2マーカー)の25人の参加者の気管支肺胞洗浄(BAL)液のマクロファージサブ表現型を調べました。これらのうち、イルミナNextSeq 500を使用して10人の患者の各サブタイプでRNAシーケンスを実行しました。マクロファージの約25%は古典的なM1またはM2表面マーカーを抱いていませんでした(二重負、DN)。非COPD患者と比較した患者(46.7%対14.5%、p <0.001)。1886遺伝子は、10%の誤検出率で他のすべてのサブタイプと比較して、DNサブタイプで差次的に発現しました。602の上方制御された遺伝子には、15のミトコンドリア遺伝子が含まれており、炎症反応を含む86の遺伝子オントロジー(GO)生物学的プロセスに濃縮されました。酸化的リン酸化を含む細胞機能に関連するモジュールは、DNサブタイプで有意にダウンレギュレートされました。M1/M2表面マーカーの両方に対して陰性であるヒトBAL液のマクロファージは、炎症誘発性であり、細胞恒常性の機能障害を示唆する遺伝子シグネチャを抱いていました。これらのマクロファージは、COPDなどの炎症性肺疾患の病因と症状に寄与する可能性があります。
マクロファージの古典的なM1/M2極性は、肺の複雑な微小環境とマクロファージの可塑性による慢性閉塞性肺疾患(COPD)を含む炎症性肺疾患には適用できない場合があります。CD40(M1マーカー)とCD163(M2マーカー)の25人の参加者の気管支肺胞洗浄(BAL)液のマクロファージサブ表現型を調べました。これらのうち、イルミナNextSeq 500を使用して10人の患者の各サブタイプでRNAシーケンスを実行しました。マクロファージの約25%は古典的なM1またはM2表面マーカーを抱いていませんでした(二重負、DN)。非COPD患者と比較した患者(46.7%対14.5%、p <0.001)。1886遺伝子は、10%の誤検出率で他のすべてのサブタイプと比較して、DNサブタイプで差次的に発現しました。602の上方制御された遺伝子には、15のミトコンドリア遺伝子が含まれており、炎症反応を含む86の遺伝子オントロジー(GO)生物学的プロセスに濃縮されました。酸化的リン酸化を含む細胞機能に関連するモジュールは、DNサブタイプで有意にダウンレギュレートされました。M1/M2表面マーカーの両方に対して陰性であるヒトBAL液のマクロファージは、炎症誘発性であり、細胞恒常性の機能障害を示唆する遺伝子シグネチャを抱いていました。これらのマクロファージは、COPDなどの炎症性肺疾患の病因と症状に寄与する可能性があります。
The classical M1/M2 polarity of macrophages may not be applicable to inflammatory lung diseases including chronic obstructive pulmonary disease (COPD) due to the complex microenvironment in lungs and the plasticity of macrophages. We examined macrophage sub-phenotypes in bronchoalveolar lavage (BAL) fluid in 25 participants with CD40 (a M1 marker) and CD163 (a M2 marker). Of these, we performed RNA-sequencing on each subtype in 10 patients using the Illumina NextSeq 500. Approximately 25% of the macrophages did not harbor classical M1 or M2 surface markers (double negative, DN), and these cells were significantly enriched in COPD patients compared with non-COPD patients (46.7% vs. 14.5%, p < 0.001). 1886 genes were differentially expressed in the DN subtype compared with all other subtypes at a 10% false discovery rate. The 602 up-regulated genes included 15 mitochondrial genes and were enriched in 86 gene ontology (GO) biological processes including inflammatory responses. Modules associated with cellular functions including oxidative phosphorylation were significantly down-regulated in the DN subtype. Macrophages in the human BAL fluid, which were negative for both M1/M2 surface markers, harbored a gene signature that was pro-inflammatory and suggested dysfunction in cellular homeostasis. These macrophages may contribute to the pathogenesis and manifestations of inflammatory lung diseases such as COPD.
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