mycobacterium v​​icinigordonae sp nov、sputから分離されたゆっくりと成長しているスコトクックマイナス種

ゆっくりと成長するスコト結色のマイコバクテリア株（24T）が、中国の男性の人間のsputから分離されました。16S rRNA遺伝子を使用した系統解析は、GordonaeとMycobacterium Paragordonaeを含むMycobacterium gordonae複合体に24T株を割り当てました。Hsp65およびRPOBシーケンスに基づく系統解析の表現型特性、ユニークなマイコール酸プロファイル、およびM. gordonae複合体の他のメンバーとは異なる種の代表として24T株の分類学的状態を強くサポートしました。株24TのゲノムG+C含有量は65.40mol％でした。ゲノムの比較により、株24TおよびM. gordonae ATCC 14470Tは平均ヌクレオチド同一性（ANI）値が81.00％、DNA-DNAハイブリダイゼーション（DDH）値が22.80％であり、ANIとDDHの値は24Tand 24Tand M.49 061Tはそれぞれ80.98と22.80％でした。系統発生、表現型、および走化期的な特徴の観点から、24T株はその最も近い系統発生的親relativeと区別でき、Mycobacterium v​​icinigordonae sp。11月。提案されています。型ひずみは24T（= CMCC 93559T = DSM 105979T）です。

A slow-growing, scotochromogenic mycobacterial strain (24T) was isolated from the sputum of a Chinese male human. Phylogenetic analysis using the 16S rRNA gene assigned strain 24T to the Mycobacterium gordonae complex, which includes Mycobacterium gordonae and Mycobacterium paragordonae. The phenotypic characteristics, unique mycolic acid profile and the results of phylogenetic analysis based on hsp65 and rpoB sequences strongly supported the taxonomic status of strain 24T as a representative of a species distinct from the other members of the M. gordonae complex. The genomic G+C content of strain 24T was 65.40mol%. Genomic comparisons showed that strain 24T and M. gordonae ATCC 14470T had an average nucleotide identity (ANI) value of 81.00 % and a DNA-DNA hybridization (DDH) value of 22.80 %, while the ANI and DDH values between strain 24Tand M. paragordonae 49 061T were 80.98 and 22.80 %, respectively. In terms of phylogenetic, phenotypic and chemotaxonomic features, strain 24T is distinguishable from its closest phylogenetic relatives and represents a novel species of the genus Mycobacterium, therefore the name Mycobacterium vicinigordonae sp. nov. is proposed. The type strain is 24T (=CMCC 93559T=DSM 105979T).