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RNAシーケンス（RNA-SEQ）データからαβ/γδT細胞およびB細胞における免疫受容体レパートリーの再構築のためのTrust4オープンソースアルゴリズムを導入します。競合する方法と比較して、Trust4はFastQとBAMの両方の形式をサポートしており、より高速でより敏感です。Trust4は、V（D）J濃縮なしの単一細胞RNA-SEQ（SCRNA-SEQ）データのレパートリーシーケンスを呼び出すこともでき、SMART-SEQおよび5 '10Xゲノミクスプラットフォームの両方と互換性があります。
RNAシーケンス（RNA-SEQ）データからαβ/γδT細胞およびB細胞における免疫受容体レパートリーの再構築のためのTrust4オープンソースアルゴリズムを導入します。競合する方法と比較して、Trust4はFastQとBAMの両方の形式をサポートしており、より高速でより敏感です。Trust4は、V（D）J濃縮なしの単一細胞RNA-SEQ（SCRNA-SEQ）データのレパートリーシーケンスを呼び出すこともでき、SMART-SEQおよび5 '10Xゲノミクスプラットフォームの両方と互換性があります。
We introduce the TRUST4 open-source algorithm for reconstruction of immune receptor repertoires in αβ/γδ T cells and B cells from RNA-sequencing (RNA-seq) data. Compared with competing methods, TRUST4 supports both FASTQ and BAM format and is faster and more sensitive in assembling longer-even full-length-receptor repertoires. TRUST4 can also call repertoire sequences from single-cell RNA-seq (scRNA-seq) data without V(D)J enrichment, and is compatible with both SMART-seq and 5' 10x Genomics platforms.
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