インドのマラリアベクターのヘモシテRNA-seq分析anopheles stephensiおよびanopheles culicifacies：類似性から違いまで

Anopheles StephensiとAnopheles Culicifaciesは、それぞれインド都市および農村部の支配的なマラリアベクターです。両方の種は、行動の適応と免疫に大きな生物学的な違いをもたらしますが、これらの変動の遺伝的基盤はまだよく理解されていません。ここでは、いくつかの免疫哲学的反応に影響を与える免疫血球の遺伝的違いを明らかにしました。両方の蚊の血球RNA-seqデータベースを生成、分析、比較しました。合計5,837,223,769の組み立てられた塩基は、7,595および3,791の転写産物に崩壊しました。比較GOアノテーション分析により、両方の蚊の血球が同様のタンパク質をコードすることが明らかになりました。さらに、and。Stephensi血球は、APHAG（オートファジー）、IMD（免疫不足経路）、PRDX（ペルオキシレディオキシン）、SCR（スカベンジャー受容体）、IAP（アポトーシス阻害剤）、Gale（ガラクトシドバインディングレクチン）、BGBPSをコードする免疫転写物の割合が高いことを示しました。、3ベータDグルカン結合タンパク質）、CASPS（カスパーゼ）およびSRRP（小さなRNA調節経路）、an。Culicifacies Hemocytesは、クリップ（Clipドメインセリンプロテアーゼ）、FREP（フィブリノーゲン関連タンパク質）、PPO（プロペノールオキシダーゼ）、SRPN（Serpines）、ML（ミエロイド分化2関連脂質認識プロテイン）、TOLL PATHパスをコードする転写産物の比較的高い割合を生成しました。およびTEP（チオエステルタンパク質）、ファミリータンパク質。ただし、詳細な比較間プロッカン分析は、。Stephensi Mosquito Hemocytesは、ANと比較して繰り返し数が増加してタンパク質をエンコードします。キューリファシー。特に、LRR（ロイシンリッチリピート）、WD40（WD40（W-dジペプチド）、アンキリン、アネキシン、テトリックペプチン、テトリコペプチド、テトリコペプチド、テトリコペプチド、ミトコンドリア基板キャリアのリピートコンテンツファミリーのプロテインなどの反復を伴うエンコードされたタンパク質の有意な変動性を示す豊富な転写産物が観察されました。種固有の免疫哲学反応に対する直接的な影響。即座に、私たちの深いシーケンス分析により、Stephensiは、ANと比較して血球タンパク質の反復配列の拡大で進化しました。キューリファイシティは、多様な環境への適応を改善するための利点を提供する可能性があります。

Anopheles stephensi and Anopheles culicifacies are dominant malarial vectors in urban and rural India, respectively. Both species carry significant biological differences in their behavioral adaptation and immunity, but the genetic basis of these variations are still poorly understood. Here, we uncovered the genetic differences of immune blood cells, that influence several immune-physiological responses. We generated, analyzed and compared the hemocyte RNA-Seq database of both mosquitoes. A total of 5,837,223,769 assembled bases collapsed into 7,595 and 3,791 transcripts, originating from hemocytes of laboratory-reared 3-4 days old naïve (sugar-fed) mosquitoes, Anopheles stephensi and Anopheles culicifacies respectively. Comparative GO annotation analysis revealed that both mosquito hemocytes encode similar proteins. Furthermore, while An. stephensi hemocytes showed a higher percentage of immune transcripts encoding APHAG (Autophagy), IMD (Immune deficiency pathway), PRDX (Peroxiredoxin), SCR (Scavenger receptor), IAP (Inhibitor of apoptosis), GALE (galactoside binding lectins), BGBPs (1,3 beta D glucan binding proteins), CASPs (caspases) and SRRP (Small RNA regulatory pathway), An. culicifacies hemocytes yielded a relatively higher percentage of transcripts encoding CLIP (Clip domain serine protease), FREP (Fibrinogen related proteins), PPO (Prophenol oxidase), SRPN (Serpines), ML (Myeloid differentiation 2-related lipid recognition protein), Toll path and TEP (Thioester protein), family proteins. However, a detailed comparative Interproscan analysis showed An. stephensi mosquito hemocytes encode proteins with increased repeat numbers as compared to An. culicifacies. Notably, we observed an abundance of transcripts showing significant variability of encoded proteins with repeats such as LRR (Leucine rich repeat), WD40 (W-D dipeptide), Ankyrin, Annexin, Tetratricopeptide and Mitochondrial substrate carrier repeat-containing family proteins, which may have a direct influence on species-specific immune-physiological responses. Summarily, our deep sequencing analysis unraveled that An. stephensi evolved with an expansion of repeat sequences in hemocyte proteins as compared to An. culicifacies, possibly providing an advantage for better adaptation to diverse environments.