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Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases2021Oct01Vol.94issue()

日本でE484Kスパイクタンパク質突然変異を運ぶ重度の急性呼吸症候群コロナウイルス2 R1系統の識別可能な増加

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

日本の3つのcovid-19波は、異なるパンゴ系統の存在によって特徴付けられています(b.1.1。162、b.1.1.284、およびb.1.1.214)。最近、25%の存在量を示すb.1.1.7系統に加えて、スパイクタンパク質のE484K変異を運ぶR.1系統が最大40%の優位性を示すことがわかりました。E484Kは、免疫脱出を媒介する可能性を秘めた、極めて重要なアミノ酸置換である可能性があります。したがって、懸念のある突然変異体の出現を避けるために、懸念のあるこのような潜在的なバリアントにもっと注意を払うべきです。このような包括的なリアルタイムゲノム監視は、Covid-19クラスターの封じ込めに不可欠になっています。

日本の3つのcovid-19波は、異なるパンゴ系統の存在によって特徴付けられています(b.1.1。162、b.1.1.284、およびb.1.1.214)。最近、25%の存在量を示すb.1.1.7系統に加えて、スパイクタンパク質のE484K変異を運ぶR.1系統が最大40%の優位性を示すことがわかりました。E484Kは、免疫脱出を媒介する可能性を秘めた、極めて重要なアミノ酸置換である可能性があります。したがって、懸念のある突然変異体の出現を避けるために、懸念のあるこのような潜在的なバリアントにもっと注意を払うべきです。このような包括的なリアルタイムゲノム監視は、Covid-19クラスターの封じ込めに不可欠になっています。

Three COVID-19 waves in Japan have been characterized by the presence of distinct PANGO lineages (B.1.1. 162, B.1.1.284, and B.1.1.214). Recently, in addition to the B.1.1.7 lineage, which shows 25% abundance, an R.1 lineage carrying the E484K mutation in the spike protein was found to show up to 40% predominance. E484K could be a pivotal amino acid substitution with the potential to mediate immune escape; thus, more attention should be paid to such potential variants of concern to avoid the emergence of mutants of concern. Such comprehensive real-time genome surveillance has become essential for the containment of COVID-19 clusters.

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