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生理食塩水アルカリの土地は世界中に分配されており、漁業の経済発展に影響を与えています。水中のアルカリ度は炭酸塩の蓄積に関連しているため、一般的に高くなります。アルカリ度がLuciobarbus capitoの免疫応答にどのように影響するかを理解するために、アルカリ度曝露を受けたLuciobarbus Capitoの免疫臓器である脾臓のトランスクリプトームプロファイルを実行しました。完全に、コントロールグループから得られた47,727,954、53,987,820、および51,398,546高品質のクリーンリード、および46,996,982、49,650,460および45,964,986のクリーンリードがアルカリ曝露グループからのクリーンリードがあります。その中で、611の遺伝子は、534の上方制御および77のダウンレギュレートされた遺伝子を含む異なる発現が異なっていました。特定された遺伝子は、遺伝子オントロジー（GO）および京都百科事典（KEGG）の京都百科事典を使用して濃縮されました。Luciobarbus capito脾臓組織の差次的に発現した遺伝子が14のGO経路に濃縮され、Luciobarbus capito脾臓の差次的に発現した遺伝子が、アルカリティーストレス下で25の対応するKegg経路に濃縮されたことがわかった。炎症および免疫機能遺伝子と経路は、定量的リアルタイムRT-PCRによって同定および検証されました。我々の結果は、アルカリ性曝露がLuciobarbus capitoの脾臓での炎症と免疫調節につながることを示しました。これらの結果は、Luciobarbus capitoにおけるアルカリ性の生物学的効果を発表するための新しい洞察を提供します。
生理食塩水アルカリの土地は世界中に分配されており、漁業の経済発展に影響を与えています。水中のアルカリ度は炭酸塩の蓄積に関連しているため、一般的に高くなります。アルカリ度がLuciobarbus capitoの免疫応答にどのように影響するかを理解するために、アルカリ度曝露を受けたLuciobarbus Capitoの免疫臓器である脾臓のトランスクリプトームプロファイルを実行しました。完全に、コントロールグループから得られた47,727,954、53,987,820、および51,398,546高品質のクリーンリード、および46,996,982、49,650,460および45,964,986のクリーンリードがアルカリ曝露グループからのクリーンリードがあります。その中で、611の遺伝子は、534の上方制御および77のダウンレギュレートされた遺伝子を含む異なる発現が異なっていました。特定された遺伝子は、遺伝子オントロジー（GO）および京都百科事典（KEGG）の京都百科事典を使用して濃縮されました。Luciobarbus capito脾臓組織の差次的に発現した遺伝子が14のGO経路に濃縮され、Luciobarbus capito脾臓の差次的に発現した遺伝子が、アルカリティーストレス下で25の対応するKegg経路に濃縮されたことがわかった。炎症および免疫機能遺伝子と経路は、定量的リアルタイムRT-PCRによって同定および検証されました。我々の結果は、アルカリ性曝露がLuciobarbus capitoの脾臓での炎症と免疫調節につながることを示しました。これらの結果は、Luciobarbus capitoにおけるアルカリ性の生物学的効果を発表するための新しい洞察を提供します。
Saline-alkali land is distributed all over the world, and it affects the economic development of fisheries. The alkalinity in water is related to the accumulation of carbonate, so the is generally higher. To understand how alkalinity impacts the immune response in Luciobarbus capito, we performed transcriptomic profiles for spleen, the immune organ of Luciobarbus capito which were underwent alkalinity exposure. Totally there are 47,727,954, 53,987,820 and 51,398,546 high quality clean reads obtained from the control groups, and 46,996,982, 49,650,460 and 45,964,986 clean reads from the alkalinity exposure groups. Among them, 611 genes were differently expressed, including 534 upregulated and 77 down-regulated genes. The identified genes were enriched using databases of Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG). It was found that differentially expressed genes in Luciobarbus capito spleen tissue were enriched into 14 GO pathways, and differentially expressed genes in Luciobarbus capito spleen were enriched into 25 corresponding KEGG pathways under alkalinity stress. Inflammation and immune function genes and pathways were identified and validated by quantitative real-time RT-PCR. Our results showed that alkalinity exposure leads to inflammation and immunoregulation in spleen of Luciobarbus capito. These results provide new insights for unveiling the biological effects of alkalinity in Luciobarbus capito.
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