mRNA 5 '末端修飾の質量分析

真核生物mRNAの5 '末端で本質的なエピトルンスクリプトームマークである7-メチルグアノシン（M7G）キャップ構造は、mRNAの安定性、輸出、および翻訳に重要な役割を果たします。CAP構造に続いて、mRNAの5 '末端の1番目と2番目のヌクレオチドは頻繁にメチル化され、特に脊椎動物でより多様な修飾が得られます。キャップ構造の生物学的役割を理解するには、5 '末端の変更の正確な分析が必要です。ここでは、mRNAの5 '末端フラグメントの質量分析のための詳細なプロトコルについて説明します。

The 7-methylguanosine (m7G) cap structure, an essential epitranscriptomic mark at the 5' terminus of eukaryotic mRNAs, plays critical roles in mRNA stability, export, and translation. Following the cap structure, the first and second nucleotides at the 5' ends of mRNAs are frequently methylated to give more diverse modifications, especially in vertebrates. To understand the biological roles of the cap structures, precise analyses of the 5' terminal modifications are necessary. Here, we describe a detailed protocol for mass spectrometric analysis of 5' terminal fragments of mRNAs.