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Frontiers in genetics20210101Vol.12issue()

中国北東部のトゥングシック語を話すマンチュの人々の人口混合物へのゲノム洞察

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文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

Manchuは、中国で3番目に大きい民族の少数派であり、Tungusicを話すグループの中で最大の人口規模を持っています。しかし、マンチュの人々の遺伝的起源と混合履歴は、まばらなサンプリングと限られた数のマーカーが遺伝子型であるため、明らかではありません。ここでは、中国北東部から収集された93人のマンチュの個人に、ジェノタイピングのゲノム全体のデータの最初のバッチをおおよそ700,000個の単一ヌクレオチド多型(SNP)を提供しました。新しく生成されたデータを、公的に利用可能な現代および古代東アジア人のデータと統合して、遺伝的多様性と微細な人口構造を包括的に特徴付け、中国北部の満州の遺伝的起源と混合歴の歴史を探求しました。混合物の説明的な方法、Finestructure、F st、Treemix、Identy(IBD)、主成分分析(PCA)、および定性的F統計(F 3、F 4、QPADM、およびQPWAVE)の両方を適用しました。リアオンのマンチュスは、ハプロタイプベースの結果のクラスターパターンに沿っている北ハン中国との密接な遺伝的関係と重要な混合シグナルを持っていることがわかりました。さらに、QPADMベースの混合モデルは、現代の満州の人々が、アミュール川のベインなどの古代の個体群に関連するイエローリバー農民と、小さな祖先に関連する主要な祖先として形成されたことを示しました。要約すると、リアオンの北東の中国の満州人は、おそらく過去数百年の大規模な人口移動と遺伝的混合物のために、トゥングシック語を話す集団の一貫した遺伝的構造の例外でした。

Manchuは、中国で3番目に大きい民族の少数派であり、Tungusicを話すグループの中で最大の人口規模を持っています。しかし、マンチュの人々の遺伝的起源と混合履歴は、まばらなサンプリングと限られた数のマーカーが遺伝子型であるため、明らかではありません。ここでは、中国北東部から収集された93人のマンチュの個人に、ジェノタイピングのゲノム全体のデータの最初のバッチをおおよそ700,000個の単一ヌクレオチド多型(SNP)を提供しました。新しく生成されたデータを、公的に利用可能な現代および古代東アジア人のデータと統合して、遺伝的多様性と微細な人口構造を包括的に特徴付け、中国北部の満州の遺伝的起源と混合歴の歴史を探求しました。混合物の説明的な方法、Finestructure、F st、Treemix、Identy(IBD)、主成分分析(PCA)、および定性的F統計(F 3、F 4、QPADM、およびQPWAVE)の両方を適用しました。リアオンのマンチュスは、ハプロタイプベースの結果のクラスターパターンに沿っている北ハン中国との密接な遺伝的関係と重要な混合シグナルを持っていることがわかりました。さらに、QPADMベースの混合モデルは、現代の満州の人々が、アミュール川のベインなどの古代の個体群に関連するイエローリバー農民と、小さな祖先に関連する主要な祖先として形成されたことを示しました。要約すると、リアオンの北東の中国の満州人は、おそらく過去数百年の大規模な人口移動と遺伝的混合物のために、トゥングシック語を話す集団の一貫した遺伝的構造の例外でした。

Manchu is the third-largest ethnic minority in China and has the largest population size among the Tungusic-speaking groups. However, the genetic origin and admixture history of the Manchu people are far from clear due to the sparse sampling and a limited number of markers genotyped. Here, we provided the first batch of genome-wide data of genotyping approximate 700,000 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in 93 Manchu individuals collected from northeast China. We merged the newly generated data with data of publicly available modern and ancient East Asians to comprehensively characterize the genetic diversity and fine-scale population structure, as well as explore the genetic origin and admixture history of northern Chinese Manchus. We applied both descriptive methods of ADMIXTURE, fineSTRUCTURE, F ST , TreeMix, identity by decedent (IBD), principal component analysis (PCA), and qualitative f-statistics (f 3, f 4, qpAdm, and qpWave). We found that Liaoning Manchus have a close genetic relationship and significant admixture signal with northern Han Chinese, which is in line with the cluster patterns in the haplotype-based results. Additionally, the qpAdm-based admixture models showed that modern Manchu people were formed as major ancestry related to Yellow River farmers and minor ancestry linked to ancient populations from Amur River Bain, or others. In summary, the northeastern Chinese Manchu people in Liaoning were an exception to the coherent genetic structure of Tungusic-speaking populations, probably due to the large-scale population migrations and genetic admixtures in the past few hundred years.

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