自己報告された人種による前立腺がんゲノムの違い：遺伝的祖先、修正可能な癌の危険因子、および臨床因子の貢献

目的：黒人男性は、前立腺癌で白人男性の2倍の頻度で死亡します。これは、遺伝的遺伝学、修正可能な癌の危険因子、およびヘルスケアへのアクセスによる格差です。自己報告された人種と遺伝的祖先によって腫瘍ゲノムがどのように、そしてなぜ異なるかは不完全に理解されていません。 実験設計：同じ癌センターで臨床グレードシーケンスを利用できる前立腺がんの2,069人の男性（1,841人の自己報告白、63人のアジア、165人の黒）のうち、腫瘍の有病率と生殖細胞の変化は、がんドライバー遺伝子で評価されました。人種による異なる変化の有病率。 結果：前立腺特異的抗原や診断時の年齢、およびサンプル調達のがん段階などの臨床的特徴は、自己申告による人種によって異なりました。ただし、ほとんどのゲノムの違いは、臨床的特徴を調整するときに持続しました。黒人男性の腫瘍は、白人男性の腫瘍よりも少ないPTEN変異とARの変化が少なくなりました。アジアの男性からの腫瘍は、白人男性よりもFOXA1変異が多く、ZFHX3の変化が多かった。TP53変異が少ないにもかかわらず、黒人男性の腫瘍は、特に染色体8Qゲインの劣性性が高く、予後不利な因子を持っていました。遺伝的祖先は、自己報告された人種と同様の腫瘍の変化に関連していましたが、修正可能ながんの危険因子とも関連していました。コミュニティレベルの平均収入は、人種と祖先を調整した後、CHR8Qの利益に関連していました。 結論：腫瘍のゲノミクスは、臨床的特徴を占めた後でも、人種によって異なっていました。ケアへの均等化アクセスは、そのような違いを完全に排除しない場合があります。人種的少数派でより一般的な変化の治療が必要です。腫瘍のゲノムの違いは、生殖細胞系の遺伝学によるものであると想定されるべきではありません。

PURPOSE: Black men die from prostate cancer twice as often as White men, a disparity likely due to inherited genetics, modifiable cancer risk factors, and healthcare access. It is incompletely understood how and why tumor genomes differ by self-reported race and genetic ancestry. EXPERIMENTAL DESIGN: Among 2,069 men with prostate cancer (1,841 self-reported White, 63 Asian, 165 Black) with access to clinical-grade sequencing at the same cancer center, prevalence of tumor and germline alterations was assessed in cancer driver genes reported to have different alteration prevalence by race. RESULTS: Clinical characteristics such as prostate-specific antigen and age at diagnosis as well as cancer stage at sample procurement differed by self-reported race. However, most genomic differences persisted when adjusting for clinical characteristics. Tumors from Black men harbored fewer PTEN mutations and more AR alterations than those from White men. Tumors from Asian men had more FOXA1 mutations and more ZFHX3 alterations than White men. Despite fewer TP53 mutations, tumors from Black men had more aneuploidy, particularly chromosome arm 8q gains, an adverse prognostic factor. Genetic ancestry was associated with similar tumor alterations as self-reported race, but also with modifiable cancer risk factors. Community-level average income was associated with chr8q gains after adjusting for race and ancestry. CONCLUSIONS: Tumor genomics differed by race even after accounting for clinical characteristics. Equalizing access to care may not fully eliminate such differences. Therapies for alterations more common in racial minorities are needed. Tumor genomic differences should not be assumed to be entirely due to germline genetics.