UHRF1は予後バイオマーカーであり、肝細胞癌における免疫細胞浸潤と相関する可能性があります

目的：この研究は、UHRF1発現、その生物学的機能、およびヒト肝細胞癌（HCC）における免疫浸潤の関係を調査するために実施されました。 方法：遺伝子発現プロファイリングインタラクティブ分析（GEPIA）、Oncomine、およびがんゲノムアトラス（TCGA）データベースを使用して、HCCと正常組織間のUHRF1発現を分析しました。その後、Gepia、TCGA-PORTAL、KAPLAN-MEIERプロッター、タンパク質アトラス、SurvexPressデータベースが生存分析のために利用されました。UHRF1共発現遺伝子は、CBioportalおよびLinkedomicsデータベースを介して同定されました。さらに、遺伝子オントロジー（GO）分析と、遺伝子およびゲノム（KEGG）分析の京都百科事典（KEGG）分析が実施されました。タンパク質間相互作用（PPI）ネットワークは、StringデータベースとCytoscape 3.7.1によって構築されました。シングルサンプル遺伝子セット濃縮分析（SSGSEA）およびCiberSortアルゴリズムを使用して、UHRF1とTCGAデータベース上の腫瘍免疫浸潤との相関を評価しました。タイマー2.0データベースを使用して、HCCのUHRF1発現と免疫浸潤レベルの相関を調査しました。さらに、RT-QPCRを使用して、HCC細胞株のUHRF1および相対遺伝子の発現を分析しました。 結果：UHRF1の発現レベルは、ペアの正常組織と比較してHCC組織で上方制御されました（GepiaではP <0.05;腫瘍ではP = 1.78E-6、TCGAではP <0.0001）。その高発現は、5つのデータベースでの全生存期間が短いことと有意に関連していました（P <0.05）。関数濃縮分析により、UHRF1の機能は細胞分裂プロセスと細胞周期に濃縮されることが実証されました（P <0.05）。高UHRF1発現は、調節不全免疫浸潤（すなわち、好中球、好酸球、樹状細胞安静時、マクロファージM2、M0）および高UHRF1発現の不十分な生存率を免疫浸潤状態と密接に相関させました。さらに、TP53変異はUHRF1の高発現につながる可能性があります（P = 4.2E-10）。 結論：UHRF1は、HCCの調節不全免疫浸潤を誘導することにより、癌遺伝子として機能し、HCCの新規予後バイオマーカーおよび潜在的な治療標的として特定されました。

OBJECTIVE: This study was performed to investigate the relationship among UHRF1 expression, its biological function and immune infiltration in human hepatocellular carcinoma (HCC). METHODS: Gene Expression Profiling Interactive Analysis (GEPIA), Oncomine, and The Cancer Genome Atlas (TCGA) databases were used to analyze UHRF1 expression between HCC and normal tissues. Subsequently, GEPIA, TCGA-Portal, Kaplan-Meier Plotter, Protein Atlas and SurvExpress databases were utilized for survival analysis. UHRF1 co-expression genes were identified via the cBioPortal and LinkedOmics databases. Further, gene ontology (GO) analysis as well as Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analysis were performed. Protein-protein interaction (PPI) networks was constructed by STRING database and Cytoscape 3.7.1. Single-sample gene set enrichment analysis (ssGSEA) and CIBERSORT algorithm were employed to assess the correlation between UHRF1 and tumor immune infiltrates on TCGA database. TIMER 2.0 database was used to explore the correlation of UHRF1 expression and immune infiltration level in HCC. Additionally, RT-qPCR was used to analyze the expression of UHRF1 and the relative genes in HCC cell lines. RESULTS: Expression level of UHRF1 was upregulated in HCC tissues compared with paired normal tissues (P < 0.05 in GEPIA; P = 1.78E-6 in Oncomine; and P < 0.0001 in TCGA). Its high expression was significantly related with a shorter overall survival in five databases (P < 0.05). Function enrichment analysis demonstrated that functions of UHRF1 concentrated in cell division process and cell cycle (P < 0.05). High UHRF1 expression exhibited dysregulated immune infiltration (ie, neutrophils, eosinophils, dendritic cells resting, macrophages M2, macrophages M0) and poor survival of high UHRF1 expression was tight correlated with immune infiltration status. Moreover, TP53 mutation can lead to high expression of UHRF1 (P = 4.2E-10). CONCLUSION: UHRF1 might function as an oncogene via inducing dysregulated immune infiltration in HCC and was identified as a novel prognostic biomarker and potential therapeutic target for HCC.