アルカリアガロースゲル電気泳動

アルカリアガロースゲルは高pHで動作し、各チミンおよびグアニン残基がプロトンを失い、アデニンおよびシトシンパートナーとの水素結合の形成を防ぎます。変性DNAは一本鎖状態で維持され、そのサイズの関数としてアルカリアガロースゲルを介して移動します。ホルムアミドや尿素などの他の変性剤は、アガロースをゴム状にするため、うまく機能しません。

Alkaline agarose gels are run at high pH, which causes each thymine and guanine residue to lose a proton and thus prevents the formation of hydrogen bonds with their adenine and cytosine partners. The denatured DNA is maintained in a single-stranded state and migrates through an alkaline agarose gel as a function of its size. Other denaturants such as formamide and urea do not work well because they cause the agarose to become rubbery.