膜men目ゲノムデータベース：改善されたGO濃縮とオーソログ分析のための新しいゲノムと注釈データセット

膜menopteran昆虫種のゲノムデータベースである膜men目ゲノムデータベース（hgd; http://hymenopteragenome.org）の更新を報告します。HGDに表される種の数はほぼ3倍になり、20個のミツバチ、23個のアリ、11個のスズメバチ、4個のこがらを含む58個の膜men目があります。再編成されたWebサイトにより、HGDは、BLASTと統合された膜menopteramineゲノムデータマイニングウェアハウスとJbrowse/Apollo Genome Browserを引き続き提供しています。すべての種の遺伝子オントロジー（GO）注釈を計算し、Uniprotから収集されたGOアノテーションデータを大幅に強化し、Go Anlated遺伝子の数が10倍以上増加しました。また、すべてのHGD種を含むオルソロジーデータセットを生成し、14の分類グループにオーソログクラスターを提供しました。新しいGo AnnotationおよびOrthologyデータは、膜menopteramineで検索し、バルクファイルのダウンロードとして利用できます。

We report an update of the Hymenoptera Genome Database (HGD; http://HymenopteraGenome.org), a genomic database of hymenopteran insect species. The number of species represented in HGD has nearly tripled, with fifty-eight hymenopteran species, including twenty bees, twenty-three ants, eleven wasps and four sawflies. With a reorganized website, HGD continues to provide the HymenopteraMine genomic data mining warehouse and JBrowse/Apollo genome browsers integrated with BLAST. We have computed Gene Ontology (GO) annotations for all species, greatly enhancing the GO annotation data gathered from UniProt with more than a ten-fold increase in the number of GO-annotated genes. We have also generated orthology datasets that encompass all HGD species and provide orthologue clusters for fourteen taxonomic groups. The new GO annotation and orthology data are available for searching in HymenopteraMine, and as bulk file downloads.