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イングリッシュグレインアブラムシ、シトビオンアベンエ（Fabricius）は、翼の発達において古典的で劇的な表現型の可塑性を示しています。遺伝的および環境の両方の入力は、アブラムシの翼のポリフェニズムに寄与します。これは、単一の遺伝子型が個別の翼のないモーフを生成する表現型の可塑性の極端な形です。RT-QPCRによる遺伝子発現推定値の時間的および空間的変動を正確に正規化するには、検証済みの参照遺伝子が必要です。この研究では、S。Avenaeトランスクリプトームから選択された11の候補参照遺伝子の安定性を、翼の発達に関連する一連の非生物的および生物的条件の下で評価されました。Delta CT、BestKeeper、NormFinder、およびGenormのランキングを統合する包括的なソフトウェアであるReffinderは、あらゆる実験条件に対して一連の参照遺伝子を提供しました。全体として、ヘリカーゼ（HEL）およびユビキチンリボソームタンパク質S27A融合タンパク質（RPS27）は、この研究で調査したほとんどの条件に適していますが、例外は存在します。具体的には、NADHデヒドロゲナーゼ（AP-NADH）および28SリボソームRNA（28S）が殺虫剤および抗生物質治療に推奨されますが、リボソームRNA L14（RPL14）および18SリボソームRNA（18S）は密度治療にそれぞれ選択されます。この研究は、S。Avenaeの翼の多繊ニズムを調査するための一連の参照遺伝子を提供し、アブラムシを制御するための新しい戦術の将来の実験におけるRT-QPCRの適用に重要です。
イングリッシュグレインアブラムシ、シトビオンアベンエ（Fabricius）は、翼の発達において古典的で劇的な表現型の可塑性を示しています。遺伝的および環境の両方の入力は、アブラムシの翼のポリフェニズムに寄与します。これは、単一の遺伝子型が個別の翼のないモーフを生成する表現型の可塑性の極端な形です。RT-QPCRによる遺伝子発現推定値の時間的および空間的変動を正確に正規化するには、検証済みの参照遺伝子が必要です。この研究では、S。Avenaeトランスクリプトームから選択された11の候補参照遺伝子の安定性を、翼の発達に関連する一連の非生物的および生物的条件の下で評価されました。Delta CT、BestKeeper、NormFinder、およびGenormのランキングを統合する包括的なソフトウェアであるReffinderは、あらゆる実験条件に対して一連の参照遺伝子を提供しました。全体として、ヘリカーゼ（HEL）およびユビキチンリボソームタンパク質S27A融合タンパク質（RPS27）は、この研究で調査したほとんどの条件に適していますが、例外は存在します。具体的には、NADHデヒドロゲナーゼ（AP-NADH）および28SリボソームRNA（28S）が殺虫剤および抗生物質治療に推奨されますが、リボソームRNA L14（RPL14）および18SリボソームRNA（18S）は密度治療にそれぞれ選択されます。この研究は、S。Avenaeの翼の多繊ニズムを調査するための一連の参照遺伝子を提供し、アブラムシを制御するための新しい戦術の将来の実験におけるRT-QPCRの適用に重要です。
The English grain aphid, Sitobion avenae (Fabricius), exhibits classic and dramatic phenotypic plasticity in wing development. Both genetic and environmental inputs contribute to the wing polyphenism in aphids, an extreme form of phenotypic plasticity in which a single genotype produces discrete winged and wingless morphs. Validated reference genes are needed to accurately normalize temporal and spatial variation in gene expression estimates by RT-qPCR. In this research, the stability of 11 candidate reference genes selected from S. avenae transcriptomes was evaluated under an array of abiotic and biotic conditions relevant to wing development. RefFinder, a comprehensive software integrating rankings from delta Ct, BestKeeper, NormFinder, and geNorm, offered a series of reference genes for every experimental condition. Overall, helicase (HEL) and ubiquitin ribosomal protein S27A fusion protein (RpS27) are suited for most of the conditions examined in this study, although exceptions do exist. Specifically, NADH dehydrogenase (Ap-NADH) and 28S ribosomal RNA (28S) are recommended for insecticide and antibiotic treatments, while ribosomal RNA L14 (RPL14) and 18S ribosomal RNA (18S) are selected for density treatment, respectively. This study provides a suite of reference genes to investigate the wing polyphenism in S. avenae, and is important for application of RT-qPCR in future experiments of novel tactics to control aphids.
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