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肺胞エキノカコシス（AE）の確認された診断は、病理学的基準と分子的証拠に基づいています。この寄生虫媒介性cestode echinococcus multilocularisによって引き起こされる病気は、人間が行き止まりの宿主として控えめに関与しています。人間では、寄生虫は主に肝臓を植民地化しますが、あらゆる臓器を植民地化し、非定型の形を引き起こすことができます。さらに、非定型の形態、肝外局在、または免疫抑制患者の場合、分子法はAEの診断を行うのに適しているかもしれません。この研究の目的は、患者のAEの診断のために、最も関連性の高い公開されたPCR技術を決定し、テストしたサンプルの性質に応じて分子診断のための最良の戦略を採用することでした。この研究では、48 AEまたは9つのいずれかのいずれかのフローズン固定パラフィン埋め込み（FFPE）サンプルを使用して、ミトコンドリア遺伝子を標的とする9つのエンドポイントPCRアッセイと1つのリアルタイムPCRアッセイ（QPCR）を評価しました。嚢胞性エキノ炎症患者。標的フラグメントジェンは84〜529 bpの範囲でした。6つのPCRアッセイは、凍結AEサンプルの100％のDNAを増幅することができ、1つのPCRについては、FFPE AEサンプルの69.8％でした。16S RRNL PCR（84 bp）は、AEサンプルの77％でPCR、およびQPCRで86.5％で陽性でした。PCRアッセイの感度は、5年未満で保存された新鮮なサンプルとFFPEサンプルでより高かった。QPCRアッセイは、テストされたサンプルの感度をさらに増加させ、Echinococcus sppの開発の必要性を確認しました。QPCRエキノコッコスの分子診断を改善する。
肺胞エキノカコシス（AE）の確認された診断は、病理学的基準と分子的証拠に基づいています。この寄生虫媒介性cestode echinococcus multilocularisによって引き起こされる病気は、人間が行き止まりの宿主として控えめに関与しています。人間では、寄生虫は主に肝臓を植民地化しますが、あらゆる臓器を植民地化し、非定型の形を引き起こすことができます。さらに、非定型の形態、肝外局在、または免疫抑制患者の場合、分子法はAEの診断を行うのに適しているかもしれません。この研究の目的は、患者のAEの診断のために、最も関連性の高い公開されたPCR技術を決定し、テストしたサンプルの性質に応じて分子診断のための最良の戦略を採用することでした。この研究では、48 AEまたは9つのいずれかのいずれかのフローズン固定パラフィン埋め込み（FFPE）サンプルを使用して、ミトコンドリア遺伝子を標的とする9つのエンドポイントPCRアッセイと1つのリアルタイムPCRアッセイ（QPCR）を評価しました。嚢胞性エキノ炎症患者。標的フラグメントジェンは84〜529 bpの範囲でした。6つのPCRアッセイは、凍結AEサンプルの100％のDNAを増幅することができ、1つのPCRについては、FFPE AEサンプルの69.8％でした。16S RRNL PCR（84 bp）は、AEサンプルの77％でPCR、およびQPCRで86.5％で陽性でした。PCRアッセイの感度は、5年未満で保存された新鮮なサンプルとFFPEサンプルでより高かった。QPCRアッセイは、テストされたサンプルの感度をさらに増加させ、Echinococcus sppの開発の必要性を確認しました。QPCRエキノコッコスの分子診断を改善する。
Confirmed diagnosis of alveolar echinococcosis (AE) is based on pathological criteria and molecular evidence. This parasite-borne disease, caused by the cestode Echinococcus multilocularis, sparingly involves humans as a dead-end host. In humans, the parasite mainly colonizes the liver but can colonize any organ and cause atypical forms, often difficult to characterize clinically. Moreover, molecular methods may be suitable to make the diagnosis of AE in cases of atypical forms, extra-hepatic localizations, or immunosuppressed patients. The aim of this study was to determine the most relevant published PCR techniques, for diagnosis of AE in patients and adopt the best strategy for molecular diagnosis depending on the nature of the tested sample. In this study, we evaluated nine end-point PCR assays and one real-time PCR assay (qPCR), targeting mitochondrial genes, using a total of 89 frozen or formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples from either 48 AE or 9 cystic echinococcosis patients. Targeted fragment-genes ranged from 84 to 529 bp. Six PCR assays were able to amplify the DNA of 100% of the frozen AE-samples and for one PCR, 69.8% of the FFPE AE-samples. The 16S rrnL PCR (84 bp) was positive in PCR for 77% of the AE samples and in qPCR for 86.5%. The sensitivity of the PCR assays was higher for fresh samples and FFPE samples stored for less than 5 years. The qPCR assay further increased sensitivity for the tested samples, confirming the need for the development of an Echinococcus spp. qPCR to improve the molecular diagnosis of echinococcoses.
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