鳥コロナウイルスの出現は、最適ではない抗体力価の下で変異体を逃がします

ワクチンの組み合わせと抗体力価の効果の準ピーシー評価を実行するために、鳥コロナウイルス（AVCOV）脱出変異体の出現に対する抗体力価の評価を行うために、市販の鶏肉育種系の5週齢の男性は、単型の1用量で筋肉内でワクチン接種されました（遺伝子型GIは筋肉質にワクチン化されました（-1）または二価（遺伝子型GI-1およびGI-11（n = 40鳥/グループ）AVCOVワクチンは、6週間後に、ベロ細胞のビーデット株（GI-1）を使用して、各グループの血清のプールを調製しましたその後、ウイルスは、二価ワクチンでワクチン接種された鳥からの治療後、潜水艦の変形のためにゲノム全体の深いシーケンスに提出されました。10-1の力価で、Spike糖タンパク質でF307iバリアントが検出され、これは重要な中和領域にマッピングされました。中和抗体の標的であり、遺伝的ドリフトの指標である可能性があります。これらの結果は、ワクチン接種後のAVCOVエスケープ変異体の進化は、ワクチン株と抗体力価のタイプに依存し、準ピーシーが他の方法では検出されない可能性があるためにコンセンサス主要な配列ではなく、準種に基づいて評価する必要があることを示しています。

To perform a quasispecies assessment of the effect of vaccine combinations and antibody titers on the emergence of Avian coronavirus (AvCoV) escape mutants, 5-week-old males from a commercial chicken breeder lineage were vaccinated intramuscularly with one dose of a monovalent (genotype GI-1) or a bivalent (genotypes GI-1 and GI-11 (n = 40 birds/group) AvCoV vaccine. Seven birds were kept as controls. Six weeks later, pools of sera of each group were prepared and incubated at virus neutralization doses of 10 and 10-1 with the Beaudette strain (GI-1) of AvCoV in VERO cells. Rescued viruses were then submitted to genome-wide deep sequencing for subconsensus variant detection. After treatment with serum from birds vaccinated with the bivalent vaccine at a titer of 10-1, an F307I variant was detected in the spike glycoprotein that mapped to an important neutralizing region, which indicated an escape mutant derived from natural selection. Further variants were detected in nonstructural proteins and non-coding regions that are not targets of neutralizing antibodies and might be indicators of genetic drift. These results indicate that the evolution of AvCoV escape mutants after vaccination depends on the type of vaccine strain and the antibody titer and must be assessed based on quasispecies rather than consensus dominant sequences only because quasispecies may be otherwise undetected.