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私たちのグループは最近、免疫グロブリンG（IgG）を含む捕獲された血清糖タンパク質のN-グリカンを直接プロファイルするための合理化された抗体捕獲スライドアレイアプローチであるグリコタイパーアッセイを開発しました。この方法では、数マイクロリットルの血清を必要とし、分析前に精製または砂糖の修飾を必要としない単純化された処理プロトコルを利用します。この方法では、マルディイメージング質量分析（IMS）による検出のためにN-グリカンを放出するために、ペプチドN-グリコシダーゼF（PnGase F）で処理され、ペプチドN-グリコシダーゼF（PnGase F）で処理されます。N結合グリカンの変化が、線維症と肝硬変の大きな患者コホートからのIgGについて報告されているため、この新しい方法を利用して、IgG1、IgG2、IgG3およびIgG4のグリコシル化を調べました。以前は、生検の106人の患者のコホートで肝臓線維症が確認されました。患者は、線維症の証拠（肝臓疾患のない41人の患者または第0期の線維症）、初期段階の線維症（10メタヴィル期1および18メタヴィルステージ2）または後期段階線維症（メタヴィル期3線維症の6人の患者と後期段階のいずれかに分類されました。37人のメタヴィルステージ4線維症（肝硬変）患者）。グリコシル化のいくつかの主要な変化が観察されました。これは、患者を線維症（感度92％、90％の特異性）、早期線維症（90％特異性の84％の感受性）または有意な線維症（94％の94％の94％の感受性として分類することが観察されました。特異性）。
私たちのグループは最近、免疫グロブリンG（IgG）を含む捕獲された血清糖タンパク質のN-グリカンを直接プロファイルするための合理化された抗体捕獲スライドアレイアプローチであるグリコタイパーアッセイを開発しました。この方法では、数マイクロリットルの血清を必要とし、分析前に精製または砂糖の修飾を必要としない単純化された処理プロトコルを利用します。この方法では、マルディイメージング質量分析（IMS）による検出のためにN-グリカンを放出するために、ペプチドN-グリコシダーゼF（PnGase F）で処理され、ペプチドN-グリコシダーゼF（PnGase F）で処理されます。N結合グリカンの変化が、線維症と肝硬変の大きな患者コホートからのIgGについて報告されているため、この新しい方法を利用して、IgG1、IgG2、IgG3およびIgG4のグリコシル化を調べました。以前は、生検の106人の患者のコホートで肝臓線維症が確認されました。患者は、線維症の証拠（肝臓疾患のない41人の患者または第0期の線維症）、初期段階の線維症（10メタヴィル期1および18メタヴィルステージ2）または後期段階線維症（メタヴィル期3線維症の6人の患者と後期段階のいずれかに分類されました。37人のメタヴィルステージ4線維症（肝硬変）患者）。グリコシル化のいくつかの主要な変化が観察されました。これは、患者を線維症（感度92％、90％の特異性）、早期線維症（90％特異性の84％の感受性）または有意な線維症（94％の94％の94％の感受性として分類することが観察されました。特異性）。
Our group has recently developed the GlycoTyper assay which is a streamlined antibody capture slide array approach to directly profile N-glycans of captured serum glycoproteins including immunoglobulin G (IgG). This method needs only a few microliters of serum and utilizes a simplified processing protocol that requires no purification or sugar modifications prior to analysis. In this method, antibody captured glycoproteins are treated with peptide N-glycosidase F (PNGase F) to release N-glycans for detection by MALDI imaging mass spectrometry (IMS). As alterations in N-linked glycans have been reported for IgG from large patient cohorts with fibrosis and cirrhosis, we utilized this novel method to examine the glycosylation of total IgG, as well as IgG1, IgG2, IgG3 and IgG4, which have never been examined before, in a cohort of 106 patients with biopsy confirmed liver fibrosis. Patients were classified as either having no evidence of fibrosis (41 patients with no liver disease or stage 0 fibrosis), early stage fibrosis (10 METAVIR stage 1 and 18 METAVIR stage 2) or late stage fibrosis (6 patients with METAVIR stage 3 fibrosis and 37 patients with METAVIR stage 4 fibrosis (cirrhosis)). Several major alterations in glycosylation were observed that classify patients as having no fibrosis (sensitivity of 92% and a specificity of 90%), early fibrosis (sensitivity of 84% with 90% specificity) or significant fibrosis (sensitivity of 94% with 90% specificity).
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