糸状ファージIKEおよびFF（M13、FDおよびF1）の遺伝子IIタンパク質は、ウイルス鎖複製中に機能的に交換できません。

遺伝子IIタンパク質は、遠い関連する糸状ファージIKEおよびFF（M13、FDおよびF1）の二本鎖DNA複製に必要な唯一のファージエンコードタンパク質です。補完研究により、IKEとFFの遺伝子IIのヌクレオチド配列とウイルス鎖複製起源のコア（ドメインA）の間にかなりの程度の相同性があるにもかかわらず、遺伝子IIタンパク質の生物学的機能は互換性がないことが実証されています。これらのタンパク質の特異性は、FFのウイルス鎖複製の効率的な開始に必要なヌクレオチド配列（ドメインB）によって決定されません。実際、我々のデータは、FFのドメインBと同様の関数を持つシーケンスが、IKEのウイルス鎖複製起源の一部を形成しないことを示しています。

Gene II protein is the only phage-encoded protein required for the double-stranded DNA replication of the distantly related filamentous phages IKe and Ff (M13, fd and f1). Complementation studies have demonstrated that, despite a significant degree of homology between the nucleotide sequences of the gene II's of IKe and Ff and the core's (domains A) of their viral strand replication origins, the biological functions of the gene II proteins are not interchangeable. The specificity of these proteins is not determined by the nucleotide sequence (domain B) which is required for efficient initiation of viral strand replication of Ff. In fact, our data indicate that a sequence with a similar function as domain B in Ff does not form part of the viral strand replication origin of IKe.