8月の開始コドンの選択は、植物や動物で異なります

タンパク質合成の開始に対するAUG開始コドンに対する位置-3でのヌクレオチドの影響は、合成mRNAを使用した2つの異なるin vitro翻訳システムで研究されました。SP6プロモーターが監督したcDNAから転写された4つのmRNAは、ヌクレオチド-3での変異を除いて同一でした。いずれの場合も、mRNAの翻訳はMR = 12,600の単一のタンパク質を生成しました。相対翻訳効率は、網状赤血球溶解物システムの階層を示しました（それぞれ位置-3のA、G、U、およびCの場合、100、85、61、38％）が小麦芽系に違いはありませんでした。網状赤血球溶解物の翻訳で観察された違いの原因として、微分mRNA分解またはポリペプチド鎖伸長が除外されました。mRNA競争は、網状赤血球溶解物の翻訳効率で観察される違いを増加させましたが、小麦胚には影響を与えませんでした。61の植物と209の動物mRNA配列の分析により、8月の開始コドンを取り巻くコンセンサスシーケンス間の定性的および定量的な違いが明らかになりました。一方、動物のコンセンサスシーケンスは、植物のためのaacaauggcであるというcaccaugでした。構造的発見と機能的所見の両方は、植物や動物のAUG開始コドンを選択する要因が大きく異なることを示唆しています。

The influence of the nucleotide at position -3 relative to the AUG initiation codon on the initiation of protein synthesis was studied in two different in vitro translation systems using synthetic mRNAs. The four mRNAs, transcribed from cDNAs directed by an SP6 promoter, were identical except for mutations at nucleotide -3. In each case, translation of mRNAs produced a single protein of Mr = 12,600. Relative translational efficiencies showed a hierarchy in the reticulocyte lysate system (100, 85, 61 and 38% for A, G, U and C in position -3, respectively) but no differences in the wheat germ system. Differential mRNA degradation or polypeptide chain elongation were excluded as causes of the differences observed in translation in the reticulocyte lysate. mRNA competition increased the differences observed in translational efficiencies in reticulocyte lysate but showed no effect in wheat germ. Analysis of 61 plant and 209 animal mRNA sequences revealed qualitative and quantitative differences between the consensus sequences surrounding AUG initiation codons. Whereas the consensus sequence for animals was CACCAUG that for plants was AACAAUGGC. Both the structural and functional findings suggest that the factors which select AUG initiation codons in plants and animals differ significantly.