長い非コーディングRNA RFPL3Sは、精巣胚細胞腫瘍の予後および免疫療法予測のバイオマーカーとして機能します

精巣胚細胞腫瘍（TGCT）の発生率は現在世界中で増加しており、そのうち患者の15％〜30％が再発と転移が発生しています。しかし、TGCTを診断し、その予後を判断するための臨床的方法は不十分なままでした。この研究では、TGCT遺伝子のレビューをレビューしてTGCT診断、予後、および治療反応のバイオマーカーとして、精巣特異的な長鎖非コードRNA（LNCRNA）RETフィンガータンパク様3S（RFPL3）の可能性を調査することを目指しました。遺伝子発現オムニバス（GEO）およびがんゲノムアトラス（TCGA）データベースの発現データ。TCGAのTGCTのコホートデータとDNAメチル化データは、TGCA、UCSC Xena、およびGEOからダウンロードされました。Gepia2、Kaplan-Meierプロッター、Linkedomics、UCSC Xena、Sangerbox Tools、GSCA、腫瘍免疫機能障害および除外など、バイオインフォマティックツールが使用されました。正常な精巣組織と比較して、RFPL3S発現はTGCTで有意に減少し、患者の腫瘍、結節、転移段階と有意に負の相関がありました。TGCTには、Hypermethylationと低コピー数のRFPL3が存在し、低いRFPL3Sは短い病気のない無増悪間隔と関連していました。RFPL3のサイレンシングは、TranswellおよびCCK-8実験によって評価されたTGCT細胞の浸潤能力と増殖能力を大幅に向上させました。さらに、RFPL3S発現は、B細胞、CD8+ T細胞、細胞毒性T細胞、天然キラー細胞などの免疫活性化細胞の浸潤と正の相関があり、TH17やTh2などの免疫抑制細胞の浸潤と負の相関がありました。免疫療法の利点がある患者には、より高いRFPL3S発現が存在していました。結論として、我々は、精巣特異的LncRNA RFPL3SがTGCTの腫瘍抑制因子として機能し、TGCTの予後予測因子として使用できること、およびTGCT免疫療法の効果を予測するマーカーとして使用できると判断しました。

The incidence of testicular germ cell tumor (TGCT) is currently on the rise worldwide, of which 15%-30% of patients have occur recurrence and metastasis. However, clinical methods for diagnosing TGCT and judging its prognosis remained inadequate. In this study, we aimed to explore the possibility of testis-specific long-chain non-coding RNA (lncRNA) Ret finger protein-like 3S (RFPL3S) as a biomarker for TGCT diagnosis, prognosis, and treatment response by reviewing the TGCT gene expression data in Gene Expression Omnibus (GEO) and The Cancer Genome Atlas (TCGA) databases. The cohort data and DNA methylation data of TGCT in TCGA were downloaded from TGCA, UCSC XENA, and GEO. The bioinformatic tools were used, including GEPIA2, Kaplan-Meier Plotter, LinkedOmics, UCSC XENA, Sangerbox Tools, GSCA, and Tumor Immune Dysfunction and Exclusion. Compared with normal testicular tissues, the RFPL3S expression was significantly reduced in TGCT, and was significantly negatively correlated with the patient's Tumor, Node, Metastasis stage. Hypermethylation and low copy number of RFPL3S were present in TGCT, and low RFPL3S was associated with short disease-free and progression-free intervals. Silencing RFPL3S significantly enhanced the invasion ability and proliferation ability of TGCT cells as evaluated by Transwell and CCK-8 experiments. Additionally, RFPL3S expression was positively correlated with the infiltration of immune-activating cells such as B cells, CD8+ T cells, cytotoxic T cells, and natural killer cells, and negatively correlated with the infiltration of immunosuppressive cells such as Th17 and Th2. Higher RFPL3S expression was present in patients with immunotherapy benefits. In conclusion, we determined that the testis-specific lncRNA RFPL3S functioned as a tumor suppressor in TGCT and could be used as a prognostic predictor of TGCT, as well as a marker to predict the effect of TGCT immunotherapy.