クローン造血と診断された腫瘍プロファイリング検査を受けている胃癌の患者の血液中のTP53バリアント

バックグラウンドクローン造血は、血液中の特定の単一クローンタイプの細胞の産生であり、しばしば癌のゲノムプロファイリングテストで見られます。クローンに病原性バリアントがある場合、体細胞または生殖系の起源を区別することが重要かもしれません。より低いマイナーな対立遺伝子頻度を持つ血液のバリアントは、ヘテロ接合生殖細胞系の起源、体性モザイク、およびクローン造血を反映する可能性があります。患者の病状と家族の状況に応じて、疑わしいバリアントを評価して患者の治療と追跡コースを決定することが重要です。症例報告胃癌の53歳の日本人男性が、治療薬を検索する癌ゲノムプロファイリング検査を受けたと報告しています。プロファイリングテストでは、腫瘍組織で9％（168/1865）、ペアの血液中の9％（168/1865）のマイナーアレル周波数TP53 C.559+2T> Gのバリアントが検出されました。TP53バリアントにはLi-fraumeni症候群の可能性があるため、爪、頬スワブ、および血液標本を使用して補助テストを実施しました。ゲノム分析では、彼の爪にTP53バリアントがないことが明らかになりました。患者は以前にプラチナベースの化学療法を受けていたが、その変異体が治療誘発性造血を反映したことを示唆している。癌患者のゲノムプロファイリング検査を実施する際にクローン造血検査を特定する結論は重要です。複数の組織を調べるために、異型がクローン造血から生じるか、生殖系統の原因であるかを判断することが、より正確な遺伝情報を提供し、患者の追跡ケアを改善することができるかどうかを判断します。

BACKGROUND Clonal hematopoiesis is the production of a specific single clonal type of cell in the blood and is often found in cancer genomic profiling tests. When the clone carries a pathogenic variant, it may be important to differentiate between somatic or germline origin. The variant in the blood that has a lower minor allele frequency could reflect heterozygous germline origin, somatic mosaicism, and clonal hematopoiesis. It is important to evaluate suspected variants to determine the course of treatment and follow-up of the patient, depending on the patient's medical condition and family situation. CASE REPORT We report a 53-year-old Japanese man with gastric cancer who underwent a cancer genomic profiling test searching for therapeutic agents. The profiling test detected a variant, TP53 c.559+2T>G minor allele frequencies of 9% (168/1865) in tumor tissue and 29.1% (58/199) in paired blood. Since the TP53 variant has the possibility of Li-Fraumeni syndrome, ancillary testing was performed using fingernails, buccal swab, and blood specimens. The genomic analysis revealed no TP53 variant in his fingernails. The patient had previously received platinum-based chemotherapies, suggesting that the variant reflected treatment-induced clonal hematopoiesis. CONCLUSIONS Identifying clonal hematopoiesis when performing genomic profiling tests for patients with cancer is important. Examining multiple tissues to determine whether a variant arises from clonal hematopoiesis or is of germline origin can provide more accurate genetic information and improve patient follow-up care.