RNA-RNAブロットハイブリダイゼーションによるコロラドダニ熱ウイルス分離株の遺伝的関連性

Orbivirusesのコロラドティックフィーバー（CTF）血清群の10個の分離株の配列関連性は、RNA-RNAブロットハイブリダイゼーションによって調べられました。各分離株の12のdsRNAゲノムセグメントを10％ポリアクリルアミドゲルで電気泳動し、セグメントを電気泳動的に膜に移し、CTFフロリオマウス採用株（CTF FMA）またはCTF SS-8から放射性標識ゲノムRNAにハイブリダイズしました。10個のCTFウイルスのすべてのゲノムセグメントは、安定したハイブリッドを形成するために74％以上の配列相同性が必要である条件下で、CTF FMAまたはCTF SS-18のいずれかを使用して交差ハイブリダイゼーションシグナルを示しました。DsRNAポリアクリルアミドゲルプロファイルは、検査された各分離株に対して独特でしたが、CTF遺伝子は、他のオルビアス血清群の間で見られたように、シーケンスの発散を示しませんでした。これらのハイブリダイゼーション分析は、CTF遺伝子プールが比較的均一であることを示唆しています。これは、中和試験におけるCTF株の複数の血清型の欠如を反映している可能性があります。それにもかかわらず、セグメント4および6のハイブリダイゼーション信号は他の遺伝子のハイブリダイゼーションシグナルよりも軽く、これら2つの遺伝子がこれらの分離株の間で最も高いシーケンス変動性を示したことを示しています。これらのデータは、他のオルビアビロス血清群のハイブリダイゼーションデータと比較されます。

The sequence relatedness of ten isolates of the Colorado tick fever (CTF) serogroup of orbiviruses was examined by RNA-RNA blot hybridization. The 12 dsRNA genome segments of each of the isolates were electrophoresed in a 10% polyacrylamide gel, the segments were transferred electrophoretically to membranes and hybridized to radiolabelled genomic RNA from CTF Florio mouse-adapted strain (CTF FMA) or CTF SS-18. All genome segments of the ten CTF viruses exhibited cross-hybridization signals with either CTF FMA or CTF SS-18, under conditions in which greater than or equal to 74% sequence homology was required to form stable hybrids. Although the dsRNA polyacrylamide gel profiles were unique for each isolate examined, the CTF genes did not exhibit sequence divergence as has been seen among other Orbivirus serogroups. These hybridization analyses suggest that the CTF gene pool is relatively homogeneous which may be a reflection of the lack of multiple serotypes of CTF strains in neutralization tests. Nevertheless, the hybridization signals of segments 4 and 6 were lighter than those of the other genes, indicating that these two genes exhibited the highest degree of sequence variability among these isolates. These data are compared with hybridization data on other Orbivirus serogroups.