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Molecular ecology2022Aug01Vol.31issue(16)

ゲノム分析は、アフリカとアジアのチーターの非常に危険な保全状態を示しています(Acinonyx Jubatus)

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

私たちは、生物多様性の損失と地球環境の変化を特徴とする世界に住んでいます。大きな肉食動物の絶滅は、野生の草食動物の制御されていない増加のような生態系に影響を与える可能性があり、それが植生の再生やコミュニティにノックオンの影響を与える可能性があります。Cheetahs(Acinonyx Jubatus)は、頂点の捕食者として重要な生態系機能を提供します。しかし、彼らはすぐに不確実な未来に向かっています。生息地の喪失、人間の生活の紛争、違法な人身売買に脅かされているため、自然に残っているのは約7100人のみです。これまでにチーター系統地理学と保全ゲノミクスの最も包括的なゲノム全体の分析を提示し、現在および過去のほぼすべての種の範囲からサンプルを組み立てています。彼らの系統地理学は、以前に考えられていたよりも複雑であり、東アフリカのチーター(A.j。Raineyi)は南アフリカの個人(A.j。jubatus)と遺伝的に異なることを示しており、明確な亜種としての認識を保証します。すべての古典的に認識されている亜種の間に強い遺伝的分化が見つかったため、チーターがほとんど分化しないという以前の発見に反論しました。アジア派とすべてのアフリカの亜種の間で最も強い分化が観察されました。我々は、非常に絶滅の危機にあるイラン(A.j。venaticus)および北西部(A.j。hecki)の亜種で高い新血を検出し、全体的なチーターとスノーヒョウとともに、すべての中で最も低いゲノム全体のヘテロサイズがあることを示しています。大きな猫。これはさらに、チーターの危険な保全状況を強調しています。私たちの結果は、この種を保護するために証拠に基づいた保全政策決定をサポートできるチーター系統地理学に関する斬新で重要な情報を提供します。これは、亜種の境界を越えた進行中および提案された転座、および違法人身売買の脅威の増加に照らして特に関連しています。

私たちは、生物多様性の損失と地球環境の変化を特徴とする世界に住んでいます。大きな肉食動物の絶滅は、野生の草食動物の制御されていない増加のような生態系に影響を与える可能性があり、それが植生の再生やコミュニティにノックオンの影響を与える可能性があります。Cheetahs(Acinonyx Jubatus)は、頂点の捕食者として重要な生態系機能を提供します。しかし、彼らはすぐに不確実な未来に向かっています。生息地の喪失、人間の生活の紛争、違法な人身売買に脅かされているため、自然に残っているのは約7100人のみです。これまでにチーター系統地理学と保全ゲノミクスの最も包括的なゲノム全体の分析を提示し、現在および過去のほぼすべての種の範囲からサンプルを組み立てています。彼らの系統地理学は、以前に考えられていたよりも複雑であり、東アフリカのチーター(A.j。Raineyi)は南アフリカの個人(A.j。jubatus)と遺伝的に異なることを示しており、明確な亜種としての認識を保証します。すべての古典的に認識されている亜種の間に強い遺伝的分化が見つかったため、チーターがほとんど分化しないという以前の発見に反論しました。アジア派とすべてのアフリカの亜種の間で最も強い分化が観察されました。我々は、非常に絶滅の危機にあるイラン(A.j。venaticus)および北西部(A.j。hecki)の亜種で高い新血を検出し、全体的なチーターとスノーヒョウとともに、すべての中で最も低いゲノム全体のヘテロサイズがあることを示しています。大きな猫。これはさらに、チーターの危険な保全状況を強調しています。私たちの結果は、この種を保護するために証拠に基づいた保全政策決定をサポートできるチーター系統地理学に関する斬新で重要な情報を提供します。これは、亜種の境界を越えた進行中および提案された転座、および違法人身売買の脅威の増加に照らして特に関連しています。

We live in a world characterized by biodiversity loss and global environmental change. The extinction of large carnivores can have ramifying effects on ecosystems like an uncontrolled increase in wild herbivores, which in turn can have knock-on impacts on vegetation regeneration and communities. Cheetahs (Acinonyx jubatus) serve important ecosystem functions as apex predators; yet, they are quickly heading towards an uncertain future. Threatened by habitat loss, human-wildlife conflict and illegal trafficking, there are only approximately 7100 individuals remaining in nature. We present the most comprehensive genome-wide analysis of cheetah phylogeography and conservation genomics to date, assembling samples from nearly the entire current and past species' range. We show that their phylogeography is more complex than previously thought, and that East African cheetahs (A. j. raineyi) are genetically distinct from Southern African individuals (A. j. jubatus), warranting their recognition as a distinct subspecies. We found strong genetic differentiation between all classically recognized subspecies, thus refuting earlier findings that cheetahs show only little differentiation. The strongest differentiation was observed between the Asiatic and all the African subspecies. We detected high inbreeding in the Critically Endangered Iranian (A. j. venaticus) and North-western (A. j. hecki) subspecies, and show that overall cheetahs, along with snow leopards, have the lowest genome-wide heterozygosity of all the big cats. This further emphasizes the cheetah's perilous conservation status. Our results provide novel and important information on cheetah phylogeography that can support evidence-based conservation policy decisions to help protect this species. This is especially relevant in light of ongoing and proposed translocations across subspecies boundaries, and the increasing threats of illegal trafficking.

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