Clove（Syzygium aromaticum）ゲノムは、ユゲノール生合成経路に関する洞察を提供します

クローブ（Syzygium aromaticum）は、世界貿易における重要な熱帯スパイス作物です。進化する環境圧力は、ゲノム情報や遺伝情報が不足しているために、栽培者に現在アクセスできない現代の特徴と選択技術を必要とします。ここでは、クローブ用の370 MBの高品質の染色体スケールゲノムアセンブリを紹介します。Myrtaceaeファミリー系養成のS. aromaticumとユーカリの壮大な種との比較ゲノム分析は、11の染色体のうち7つの優れたゲノム構造の保存と染色体内再編成を保存します。クローブ製品の主要な生物活性成分であるエウゲノールの生合成に関与する家族に属する遺伝子を報告します。トランスクリプトームおよびメタボロミクスの所見に基づいて、酢酸ユージノールがクローブの葉と芽における高エウゲノールの蓄積に重要な役割を果たす仮想シナリオを提案します。Clove Genomeは、MyrtaceaeファミリーのOMICSリソースへの新しい貢献であり、Clove研究のための重要なツールです。

The clove (Syzygium aromaticum) is an important tropical spice crop in global trade. Evolving environmental pressures necessitate modern characterization and selection techniques that are currently inaccessible to clove growers owing to the scarcity of genomic and genetic information. Here, we present a 370-Mb high-quality chromosome-scale genome assembly for clove. Comparative genomic analysis between S. aromaticum and Eucalyptus grandis-both species of the Myrtaceae family-reveals good genome structure conservation and intrachromosomal rearrangements on seven of the eleven chromosomes. We report genes that belong to families involved in the biosynthesis of eugenol, the major bioactive component of clove products. On the basis of our transcriptomic and metabolomic findings, we propose a hypothetical scenario in which eugenol acetate plays a key role in high eugenol accumulation in clove leaves and buds. The clove genome is a new contribution to omics resources for the Myrtaceae family and an important tool for clove research.