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バックグラウンド:サイトゾルDNAセンサーサイクリックGMP-AMPシンターゼ(CGAS)は、セカンドメッセンジャーサイクリックグアノシンモノリン酸アデノシンモノリン酸(CGAMP)の産生を介して、自然免疫応答に重要な機能を繰り返し、インターフェロン遺伝子のアダプター刺激装置(STING)を刺激します。ただし、ヒトがんのCGASスチング経路の臨床的関連性と予後価値は、ほとんど未踏のままです。 方法:CGASスコアに関連する遺伝子署名が特定されました。CGASスイング発現の汎癌の景観は、TCGAコホートから取得したRNaseQデータを使用して計算されました。腫瘍浸潤免疫細胞(TIICS)は、SSGSEA法によって決定されました。Kaplan-Meier曲線、Cox回帰分析、および曲線下の面積(AUC)を使用して、いくつかの人間の癌にわたるCGASスチングリスクスコアとTIICSの予測値を解読しました。 結果:ほとんどの腫瘍組織は、前立腺腺癌(PRAD)および子宮内膜子宮内膜癌(UCEC)を除き、対応する非腫瘍組織と比較してより高いCGASスコアを示しました。CGASスコアの高いスコアは、腎臓腎腎癌(KIRC)および腎臓腎乳頭細胞癌(KIRP)の臨床転帰不良と密接に関連していましたが、CGAS刺されたスコアは、眼球細胞腫および麻痺(PCPG)のより良い予後を予測しました。濃縮分析により、CGASスチングは、KIRC、KIRP、およびPCPGの多様な免疫関連経路に深く関与していることが示されました。活性化CD8+ T細胞、活性化されたCD4+ T細胞、単球、およびマスト細胞を含むCGASスコアスコアとTIICSの間に有意な正の相関が認められました。最後に、CGASスコアはKIRC患者にとって独立した予後因子であることが明らかになり、KIRCおよびKIRP患者の予後評価のための強力な予測力を持っていました。 結論:特にKIRCおよびKIRPで、新しい予後指標と治療標的として機能することができる、ヒトが癌全体で生存と腫瘍の免疫を予測するために、CGASスチング遺伝子シグネチャを構築しました。
バックグラウンド:サイトゾルDNAセンサーサイクリックGMP-AMPシンターゼ(CGAS)は、セカンドメッセンジャーサイクリックグアノシンモノリン酸アデノシンモノリン酸(CGAMP)の産生を介して、自然免疫応答に重要な機能を繰り返し、インターフェロン遺伝子のアダプター刺激装置(STING)を刺激します。ただし、ヒトがんのCGASスチング経路の臨床的関連性と予後価値は、ほとんど未踏のままです。 方法:CGASスコアに関連する遺伝子署名が特定されました。CGASスイング発現の汎癌の景観は、TCGAコホートから取得したRNaseQデータを使用して計算されました。腫瘍浸潤免疫細胞(TIICS)は、SSGSEA法によって決定されました。Kaplan-Meier曲線、Cox回帰分析、および曲線下の面積(AUC)を使用して、いくつかの人間の癌にわたるCGASスチングリスクスコアとTIICSの予測値を解読しました。 結果:ほとんどの腫瘍組織は、前立腺腺癌(PRAD)および子宮内膜子宮内膜癌(UCEC)を除き、対応する非腫瘍組織と比較してより高いCGASスコアを示しました。CGASスコアの高いスコアは、腎臓腎腎癌(KIRC)および腎臓腎乳頭細胞癌(KIRP)の臨床転帰不良と密接に関連していましたが、CGAS刺されたスコアは、眼球細胞腫および麻痺(PCPG)のより良い予後を予測しました。濃縮分析により、CGASスチングは、KIRC、KIRP、およびPCPGの多様な免疫関連経路に深く関与していることが示されました。活性化CD8+ T細胞、活性化されたCD4+ T細胞、単球、およびマスト細胞を含むCGASスコアスコアとTIICSの間に有意な正の相関が認められました。最後に、CGASスコアはKIRC患者にとって独立した予後因子であることが明らかになり、KIRCおよびKIRP患者の予後評価のための強力な予測力を持っていました。 結論:特にKIRCおよびKIRPで、新しい予後指標と治療標的として機能することができる、ヒトが癌全体で生存と腫瘍の免疫を予測するために、CGASスチング遺伝子シグネチャを構築しました。
BACKGROUND: The cytosolic DNA sensor cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) plays critical functions in innate immune responses via the production of the second messenger cyclic guanosine monophosphate-adenosine monophosphate (cGAMP), which stimulates the adaptor stimulator of interferon genes (STING). However, the clinical relevance and prognostic value of the cGAS-STING pathway in human cancers remains largely unexplored. METHODS: A gene signature related to the cGAS-STING score was identified. The pan-cancer landscape of cGAS-STING expression was calculated using the RNAseq data acquired from the TCGA cohort. Tumor-infiltrating immune cells (TIICs) were determined by the ssGSEA method. Kaplan-Meier curves, Cox regression analyses, and the area under the curve (AUC) were employed to decipher the predictive value of cGAS-STING risk score and TIICs across several human cancers. RESULTS: Most tumor tissues displayed a higher cGAS-STING score compared with their corresponding nontumor tissues, except for prostate adenocarcinoma (PRAD) and uterine corpus endometrial carcinoma (UCEC). Higher cGAS-STING score was closely associated with poor clinical outcome of kidney renal clear cell carcinoma (KIRC) and kidney renal papillary cell carcinoma (KIRP), whereas the cGAS-STING score predicted a better prognosis in pheochromocytoma and paraganglioma (PCPG). Enrichment analysis showed that cGAS-STING was profoundly implicated in diverse immune-related pathways in KIRC, KIRP, and PCPG. Significant positive correlations were noticed between cGAS-STING score and TIICs, including activated CD8+ T cells, activated CD4+ T cells, monocytes, and mast cells. Finally, the cGAS-STING score was revealed to be an independent prognostic factor for KIRC patients and possessed a strong predictive power for the prognostic evaluation of KIRC and KIRP patients. CONCLUSIONS: We constructed a cGAS-STING gene signature to predict survival and tumor immunity across human cancers, which can serve as a novel prognostic indicator and therapeutic target, especially in KIRC and KIRP.
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