H1N1 G4ブタインフルエンザT細胞エピトープ分析ブタおよびヒトワクチンおよび循環株は、豚と人間に対する潜在的なリスクを明らかにします

背景：パンデミックインフルエンザウイルスは、動物貯留層から出現し、ヒト集団に交差反応性抗体がない場合に人間の間で広がる可能性があります。ワクチン中の高度に保存されたT細胞エピトープに対する免疫応答は、交差保護抗体反応が不足している場合でも、罹患率を低下させ、新しいウイルスの拡散を制限する可能性があります。 方法：確立されたエピトープ含有量の予測と比較ツールであるエピトープ含有量の比較（EPICC）を使用して、咲くH1N1 G4ブタインフルエンザAウイルス（G4）が豚とヒトの個体群に影響を与える可能性を評価しました。ヒト季節および実験的インフルエンザワクチンのHAシーケンス、ヨーロッパおよびG4に対する米国（米国）の豚インフルエンザワクチンの総クロスコンサートされたT細胞エピトープ含有量を特定して計算しました。 結果：米国の市販のブタワクチンの全体的なT細胞エピトープ含有量は、G4で保存されておらず、平均T細胞エピトープカバーは35.7％でした。現在のヒトインフルエンザワクチンと循環ヒトインフルエンザ株を比較するためのEPICCスコアも非常に低かった。対照的に、最近のヨーロッパのブタインフルエンザワクチン（HL03）のT細胞エピトープカバレッジは、G4に対して65.8％でした。 結論：米国における緊急のG4と豚とヒトインフルエンザワクチンの間のT細胞エピトープの相互保存が不十分である可能性があり、保護抗体反応がない場合、G4が豚とヒト集団に拡散することができます。ヨーロッパの1つのインフルエンザワクチン、HL03は、緊急のG4を保護する可能性があります。この研究では、豚およびヒト集団における緊急ウイルスに対する既存のワクチン株の前向き評価のためのEPICCツールの使用を示しています。

BACKGROUND: Pandemic influenza viruses may emerge from animal reservoirs and spread among humans in the absence of cross-reactive antibodies in the human population. Immune response to highly conserved T cell epitopes in vaccines may still reduce morbidity and limit the spread of the new virus even when cross-protective antibody responses are lacking. METHODS: We used an established epitope content prediction and comparison tool, Epitope Content Comparison (EpiCC), to assess the potential for emergent H1N1 G4 swine influenza A virus (G4) to impact swine and human populations. We identified and computed the total cross-conserved T cell epitope content in HA sequences of human seasonal and experimental influenza vaccines, swine influenza vaccines from Europe and the United States (US) against G4. RESULTS: The overall T cell epitope content of US commercial swine vaccines was poorly conserved with G4, with an average T cell epitope coverage of 35.7%. EpiCC scores for the comparison between current human influenza vaccines and circulating human influenza strains were also very low. In contrast, the T cell epitope coverage of a recent European swine influenza vaccine (HL03) was 65.8% against G4. CONCLUSIONS: Poor T cell epitope cross-conservation between emergent G4 and swine and human influenza vaccines in the US may enable G4 to spread in swine and spillover to human populations in the absence of protective antibody response. One European influenza vaccine, HL03, may protect against emergent G4. This study illustrates the use of the EpiCC tool for prospective assessment of existing vaccine strains against emergent viruses in swine and human populations.