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マトリックス支援レーザー脱着/フライト質量分析時間（MALDI-TOF MS）によるノカルディおよびマイコバクテリウム種の同定は、適切なタンパク質抽出手順と広範なデータベースの両方を必要とする困難なタスクです。この研究の目的は、Nocardia sppを識別するための更新されたRUO（v4.17）およびIVD（v3.2）データベースと組み合わせたVitek MS Plusシステムを評価することを目的としています。およびMycobacterium spp。臨床分離株。サンプル調製は、タンパク質抽出のためにVitek MS Mycobacterium/Nocardiaキットを使用して実行されました。90 Nocardia spp。分析された分離株、86（95.6％）は、IVDを使用して種または複雑なレベルで、RUOを使用して78（86.7％）を使用して複雑なレベルで正しく特定されました。同じ複合体に関連する他の種として誤認されたのは2つの株のみでした。液体培地からテストされた106の非結節性マイコバクテリウム臨床分離株のうち、Vitek MSは種または複雑なレベル96（90.6％）分離株で正しく識別され、RUOモードで89（84.0％）分離株が分離されました。誤解は検出されませんでした。IVDモードはM. fortuitumコンプレックスのメンバーを区別することができませんでしたが、RuoモードはM. PeregrinumとM. shipticumを正しく識別しました。このシステムによって示された堅牢性と精度により、臨床研究所におけるこれらの微生物を日常的に識別するための実装が可能になります。
マトリックス支援レーザー脱着/フライト質量分析時間（MALDI-TOF MS）によるノカルディおよびマイコバクテリウム種の同定は、適切なタンパク質抽出手順と広範なデータベースの両方を必要とする困難なタスクです。この研究の目的は、Nocardia sppを識別するための更新されたRUO（v4.17）およびIVD（v3.2）データベースと組み合わせたVitek MS Plusシステムを評価することを目的としています。およびMycobacterium spp。臨床分離株。サンプル調製は、タンパク質抽出のためにVitek MS Mycobacterium/Nocardiaキットを使用して実行されました。90 Nocardia spp。分析された分離株、86（95.6％）は、IVDを使用して種または複雑なレベルで、RUOを使用して78（86.7％）を使用して複雑なレベルで正しく特定されました。同じ複合体に関連する他の種として誤認されたのは2つの株のみでした。液体培地からテストされた106の非結節性マイコバクテリウム臨床分離株のうち、Vitek MSは種または複雑なレベル96（90.6％）分離株で正しく識別され、RUOモードで89（84.0％）分離株が分離されました。誤解は検出されませんでした。IVDモードはM. fortuitumコンプレックスのメンバーを区別することができませんでしたが、RuoモードはM. PeregrinumとM. shipticumを正しく識別しました。このシステムによって示された堅牢性と精度により、臨床研究所におけるこれらの微生物を日常的に識別するための実装が可能になります。
Identification of Nocardia and Mycobacterium species by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) is still a challenging task that requires both suitable protein extraction procedures and extensive databases. This study aimed to evaluate the VITEK MS Plus system coupled with updated RUO (v4.17) and IVD (v3.2) databases for the identification of Nocardia spp. and Mycobacterium spp. clinical isolates. Sample preparation was carried out using the VITEK MS Mycobacterium/Nocardia kit for protein extraction. From 90 Nocardia spp. isolates analysed, 86 (95.6%) were correctly identified at species or complex level using IVD and 78 (86.7%) using RUO. Only two strains were misidentified as other species pertaining to the same complex. Among the 106 non-tuberculous Mycobacterium clinical isolates tested from a liquid culture medium, VITEK MS identified correctly at species or complex level 96 (90.6%) isolates in the IVD mode and 89 (84.0%) isolates in the RUO mode. No misidentifications were detected. Although the IVD mode was unable to differentiate members of the M. fortuitum complex, the RUO mode correctly discriminated M. peregrinum and M. septicum. The robustness and accuracy showed by this system allow its implementation for routine identification of these microorganisms in clinical laboratories.
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