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小児腎症(NL)または腎臓結石疾患(KSD)は、アジアの人口において無視されたトピックです。西洋諸国では、小児NLの年間発生率は約6〜10%です。ここでは、インドの西ベンガルのデータを、NLの低い年齢(LA、0〜20歳)とその有病率を初めて提示します。KSDに関連する変異を発見するために、それぞれ24(18 + 6)のまれなLA-NL患者が、それぞれ全exomeシーケンス(WES)とサンガーシーケンスに選択されました。GRHPR cが発見されました。494G> A変異(MZ826703)は、私たちの研究コホートで主要です。この特定のホモ接合変異は、ヒト末梢単核細胞(PBMC)サンプルから直接機能的に研究されています。生化学的活性と計算分析による発現研究を使用して、変異が機能の喪失とともに病原性であると想定しました。さらに、3つの遺伝子、AGXT、HOGA1、およびGRHPRを含むGRHPRは、高酸素尿を引き起こすことが知られていることが知られていることが頻繁に発見されました。私たちの研究では、LA-NLを引き起こす遺伝子と変動、およびGRHPR変異の分子機能を分析します。これは、インド東部の西ベンガルの集団の臨床マーカーとして機能する可能性があります。
小児腎症(NL)または腎臓結石疾患(KSD)は、アジアの人口において無視されたトピックです。西洋諸国では、小児NLの年間発生率は約6〜10%です。ここでは、インドの西ベンガルのデータを、NLの低い年齢(LA、0〜20歳)とその有病率を初めて提示します。KSDに関連する変異を発見するために、それぞれ24(18 + 6)のまれなLA-NL患者が、それぞれ全exomeシーケンス(WES)とサンガーシーケンスに選択されました。GRHPR cが発見されました。494G> A変異(MZ826703)は、私たちの研究コホートで主要です。この特定のホモ接合変異は、ヒト末梢単核細胞(PBMC)サンプルから直接機能的に研究されています。生化学的活性と計算分析による発現研究を使用して、変異が機能の喪失とともに病原性であると想定しました。さらに、3つの遺伝子、AGXT、HOGA1、およびGRHPRを含むGRHPRは、高酸素尿を引き起こすことが知られていることが知られていることが頻繁に発見されました。私たちの研究では、LA-NLを引き起こす遺伝子と変動、およびGRHPR変異の分子機能を分析します。これは、インド東部の西ベンガルの集団の臨床マーカーとして機能する可能性があります。
Pediatric nephrolithiasis (NL) or Kidney stone disease (KSD) is an untethered topic in Asian population. In Western countries, the annual incidence of paediatric NL is around 6-10%. Here, we present data from West Bengal, India, on lower age (LA, 0-20 years) NL and its prevalence for the first time. To discover the mutations associated with KSD, twenty-four (18 + 6) rare LA-NL patients were selected for Whole Exome Sequencing (WES) and Sanger sequencing, respectively. It was found that GRHPR c. 494G>A mutation (MZ826703) is predominant in our study cohort. This specific homozygous mutation is functionally studied for the first time directly from human peripheral mononuclear cell (PBMC) samples. Using expression study with biochemical activity and computational analysis we assumed that the mutation is pathogenic with loss of function. Moreover, three genes, AGXT, HOGA1 and GRHPR with Novel variants known to cause hyperoxaluria were found frequently in the study cohort. Our study analyses the genes and variations that cause LA-NL, as well as the molecular function of the GRHPR mutation, which may serve as a clinical marker in the population of West Bengal, Eastern India.
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