ショートチェーンデヒドロゲナーゼ/レダクターゼ（SDR）ファミリーの遺伝子構造の進化

SDR（ショートチェーンデヒドロゲナーゼ/レダクターゼ）は、家族内でさえ低いパーセントのアイデンティティのために分類が問題であるタンパク質の最も古くて不均一なスーパーファミリーの1つです。SDR分子の進化に関するより明確な洞察を得るために、脊椎動物および無脊椎動物のオーソログ全体にわたる75のヒトSDR遺伝子のスプライシング部位組織を調査しました。ヒトSDR7CおよびSDR42Eファミリーのメンバーに、共通の無脊椎動物の祖先から独立した進化的軌跡の手がかりを提供する異常な遺伝子構造が見つかりました。同じ分析により、ヒトと無脊椎動物の非アレン性変異体の間の同一性値は、必ずしも相同遺伝子構造に関連していないことが明らかになりました。したがって、同じファミリーにヒトSDR40C1およびSDR7C遺伝子を含めることにより、SDR命名法の改訂が提案されています。

SDR (Short-chain Dehydrogenases/Reductases) are one of the oldest and heterogeneous superfamily of proteins, whose classification is problematic because of the low percent identity, even within families. To get clearer insights into SDR molecular evolution, we explored the splicing site organization of the 75 human SDR genes across their vertebrate and invertebrate orthologs. We found anomalous gene structures in members of the human SDR7C and SDR42E families that provide clues of retrogene properties and independent evolutionary trajectories from a common invertebrate ancestor. The same analyses revealed that the identity value between human and invertebrate non-allelic variants is not necessarily associated with the homologous gene structure. Accordingly, a revision of the SDR nomenclature is proposed by including the human SDR40C1 and SDR7C gene in the same family.