健康的および変化したマイクロバイオーム（異常症）における腸内IgAコーティングバクテリアおよび成功した糞便微生物叢移植における予測値

腸内のIgAコーティングされた細菌（IgA-Biome）は、微生物侵略者の阻害と腸の上皮単層を保護することにより、健康な人に恒常性機能を提供します。このグループの細菌を検出するために使用される実験方法には、フローサイトメトリーとDNAシーケンス（IgA-seq）が必要です。異常症（ミクロビオームの多様性の低下）では、IgA-Biomeも損なわれています。腸内感染症、経口ワクチン、または腸炎症性障害の存在下で、IgA-Biomeは病原性細菌または外来抗原に焦点を当てていますが、異常症に関連する他の慢性疾患では、IgA-Biomeの容量が減少します。糞便性微生物叢移植（FMT）、液体症の患者に投与されたよくスクリーンの健康なドナーからの糞便産物の使用は、健康な微生物叢と代謝物の腸を浸透させることに成功しています。FMTを通じて、IgAコーティングされた細菌は、免疫コーティングを保持しているレシピエントに移されました。これらの粘膜関連の細菌は、遊離管腔生物よりも移植の成功と関連している可能性が高いため、IgA-BiomeはFMT研究で評価されるべきです。微生物叢の前およびFMT後の研究は、少なくとも種レベルで細菌を特定するメタゲノム法を採用して、研究間の微生物叢データの比較を可能にしながら、関心のある生物をよりよく識別する必要があります。

IgA-coated bacteria in the gut (IgA-biome) provide a homeostatic function in healthy people through inhibition of microbial invaders and by protecting the epithelial monolayer of the gut. The laboratory methods used to detect this group of bacteria require flow cytometry and DNA sequencing (IgA-Seq). With dysbiosis (reduced diversity of the microbiome), the IgA-biome also is impaired. In the presence of enteric infection, oral vaccines, or an intestinal inflammatory disorder, the IgA-biome focuses on the pathogenic bacteria or foreign antigens, while in other chronic diseases associated with dysbiosis, the IgA-biome is reduced in capacity. Fecal microbiota transplantation (FMT), the use of fecal product from well-screened, healthy donors administered to patients with dysbiosis, has been successful in engrafting the intestine with healthy microbiota and metabolites leading to improve health. Through FMT, IgA-coated bacteria have been transferred to recipients retaining their immune coating. The IgA-biome should be evaluated in FMT studies as these mucosal-associated bacteria are more likely to be associated with successful transplantation than free luminal organisms. Studies of the microbiome pre- and post-FMT should employ metagenomic methods that identify bacteria at least at the species level to better identify organisms of interest while allowing comparisons of microbiota data between studies.