アルジェリアのスキーダのアブデレザック・ブーハラ病院の新生児集中治療室で分離されたグラム陰性菌の間の抗菌抵抗性

背景：この研究の目的は、新生児集中治療室（NICU）集団で分離されたグラム陰性菌（GNB）の疫学を決定し、抗生物質感受性パターンと関連する危険因子を評価することを目的としています。方法：2019年3月から5月までの新生児感染症の臨床診断を受けて、Abderrezak-Bouhara病院（Skikda、Algeria）のNICUに認められたすべての新生児は含まれていました。拡張スペクトルβ-ラクタマーゼ（ESBLS）、プラスミディンセファロスポリナーゼ（PAMPC）、およびカルバペネマーゼ遺伝子は、ポリメラーゼ連鎖反応（PCR）および配列決定によりスクリーニングされました。カルバペネム耐性のPseudomonas緑膿菌分離株の間でのOPRDのPCR増幅も実施されました。ESBLS分離株のクローン関連性は、多焦点シーケンスタイピング（MLST）を使用して研究されました。結果：148の臨床標本のうち、36（24.3％）のGNB株が尿（n = 22）、創傷（n = 8）、便（n = 3）、および血液（n = 3）サンプルから分離されました。同定された細菌種は、大腸菌（n = 13）、肺炎Klebsiella（n = 5）、Enterobacter cloacae（n = 3）、Serratia Marcescens（n = 3）、Salmonella sppでした。（n = 3）、Proteus mirabilis（n = 1）、P。aeruginosa（n = 5）、およびacinetobacter baumannii（n = 3）。PCRとシーケンスは、11の腸内菌分離株がBLACTX-M-15遺伝子を抱いていることを示し、2つの大腸菌分離株がBlacmy-2遺伝子を抱き、3つのA. baumannii分離株がBlaoxa-23およびBlaoxa-51遺伝子の両方を抱いていることを示しました。また、緑膿菌の5つの株が、OPRD遺伝子の突然変異を抱くことがわかった。MLSTは、K。pneumoniae株はSt13およびSt189に属し、大腸菌はSt69に属し、E。cloacaeがSt214に属していることを示しました。女性の性別、5分間のApgarスコア<8 <8、経腸栄養、抗生物質の使用、入院期間など、陽性のGNB培養を予測できるさまざまな危険因子が見つかりました。結論：私たちの研究は、新生児感染を引き起こす病原体の疫学を決定することの重要性を強調しています。その配列タイプ（ST）、および抗生物質感受性パターンは、正しい抗生物質治療レジメンに迅速に対処することです。

Background: This study aimed to determine the epidemiology of gram-negative bacteria (GNB) isolated in the newborn intensive care unit (NICU) population, to assess their antibiotic susceptibility patterns and possible associated risk factors. Methods: All neonates admitted to the NICU of ABDERREZAK-BOUHARA hospital (Skikda, Algeria) with a clinical diagnosis of neonatal infections from March to May 2019 were included in the study. The extended-spectrum β-lactamase (ESBLs), plasmidic cephalosporinase (pAmpC), and carbapenemases genes were screened by polymerase chain reaction (PCR) and sequencing. PCR amplification of oprD among carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa isolates was also performed. The clonal relatedness of the ESBLs isolates was studied using multilocus sequence typing (MLST). Results: Among 148 clinical specimens, 36 (24.3%) GNB strains were isolated from urine (n = 22), wound (n = 8), stool (n = 3), and blood (n = 3) samples. The bacterial species identified were Escherichia coli (n = 13), Klebsiella pneumoniae (n = 5), Enterobacter cloacae (n = 3), Serratia marcescens (n = 3), Salmonella spp. (n = 3), Proteus mirabilis (n = 1), P. aeruginosa (n = 5), and Acinetobacter baumannii (n = 3). PCR and sequencing showed that eleven Enterobacterales isolates harbored the blaCTX-M-15 gene, two E. coli isolates harbored the blaCMY-2 gene, and three A. baumannii isolates harbored both blaOXA-23 and blaOXA-51 genes. Also, five strains of P. aeruginosa were found to harbor mutations in the oprD gene. MLST showed that the K. pneumoniae strains belonged to ST13 and ST189, E. coli belonged to ST69, and E. cloacae belonged to ST214. Different risk factors that could predict positive GNB cultures were found, including female sex, Apgar score <8 at 5 min of life, enteral nutrition, antibiotic use, and extended length of hospitalization. Conclusion: Our study highlights the importance of determining the epidemiology of pathogens causing neonatal infections, their sequence types (ST), and their antibiotic susceptibility patterns to address rapidly a correct antibiotic treatment regimen.