地上の等脚類シンビオン「Candidatus hepatincola porcellionum」は、潜在的な栄養スカベンジャーです。

注文ホロスポレール（アルファプロテオバクテリア）には、多様な真核生物の義務的な細胞内細菌共生生物が含まれます。これらの細菌には、非常に合理化されたゲノムがあり、宿主にマイナスのフィットネス効果をもたらす可能性があります。ここでは、 'CAの最初のゲノム配列の比較分析を提示します。Hepatincola porcellionum '、陸生等脚子の中腸内腺で細胞外に発生する能力的な共生生物。長い読み取りと短い読みのシーケンスの組み合わせを使用して、2つのHepatincola株の完全な円形ゲノムと追加のメタゲノムが組み立てられたドラフトゲノムを取得しました。系統発生分析は、原生生物に関連する他のすべての確立されたホロスポレール科と比較して、その系統発生の位置を早期分岐ファミリーレベルクレードとして検証しました。16S RRNA遺伝子調査では、この新しいファミリーには、海洋と陸生の両方の宿主種の両方に関連する多様な細菌が含まれており、ホロスポレール菌の宿主範囲を原生生物からエクジソアのいくつかの門に拡大します（節足動物とプリアプリダ）。Hepatincolaには、代謝および生合成能力が低下し、膜貫通輸送体の大規模なレパートリーを備えた高度に合理化されたゲノムがあります。これは、この共生生物は、宿主の栄養プロバイダーよりも栄養スカベンジャーであり、栄養豊富な環境から恩恵を受けるために必要なすべての代謝物と前駆体をインポートする可能性が高いことを示唆しています。Hepatincolaは、原生生物関連のホロスポレールと比較して、異なる細菌分泌システムをさらに持っており、宿主生物に応じて異なる宿主シンバイオンの相互作用を示唆しています。

The order Holosporales (Alphaproteobacteria) encompasses obligate intracellular bacterial symbionts of diverse Eukaryotes. These bacteria have highly streamlined genomes and can have negative fitness effects on the host. Herein, we present a comparative analysis of the first genome sequences of 'Ca. Hepatincola porcellionum', a facultative symbiont occurring extracellularly in the midgut glands of terrestrial isopods. Using a combination of long-read and short-read sequencing, we obtained the complete circular genomes of two Hepatincola strains and an additional metagenome-assembled draft genome. Phylogenomic analysis validated its phylogenetic position as an early-branching family-level clade relative to all other established Holosporales families associated with protists. A 16S rRNA gene survey revealed that this new family encompasses diverse bacteria associated with both marine and terrestrial host species, which expands the host range of Holosporales bacteria from protists to several phyla of the Ecdysozoa (Arthropoda and Priapulida). Hepatincola has a highly streamlined genome with reduced metabolic and biosynthetic capacities as well as a large repertoire of transmembrane transporters. This suggests that this symbiont is rather a nutrient scavenger than a nutrient provider for the host, likely benefitting from a nutrient-rich environment to import all necessary metabolites and precursors. Hepatincola further possesses a different set of bacterial secretion systems compared to protist-associated Holosporales, suggesting different host-symbiont interactions depending on the host organism.