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European journal of biochemistry1987Dec30Vol.170issue(1-2)

Bacillus stearothermophilusおよび高度に保存されたタンパク質S19の配列測定からのリボソームタンパク質の半整理HPLC精製

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文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

従来のオープンコラムクロマトグラフィーでは分離できなかったバチルスステアオザーモフィラス30Sリボソームサブユニットのいくつかのタンパク質は、半格闘的な逆位相C4カラムを使用して高性能液体クロマトグラフィーによって精製されました。タンパク質S19はこの手法によって精製され、完全なアミノ酸配列が決定されました。タンパク質S19を断片化し、ピコモール量で分離したペプチドを改善されたマニュアル4-N、N-ジメチルアミノアゾベンゼン-4'-イソチオシアネート(DABITC)技術によって配列決定しました。S19配列における5つの連続したC末端リジンの存在は、気相シーケンスと高速酸爆撃(FAB)質量分析によって確認されました。タンパク質S19は、10,428 Daの分子量に対応する91アミノ酸残基で構成されています。B. stearothermophilus S19配列の71%は、大腸菌[Yaguchi and Wittmann(1978)、Febs Lettの対応するリボソームタンパク質と同一であることがわかった。88、227]および両方のシーケンスは、ギャップなしで整列できます。B. stearothermophilusおよび大腸菌リボソームの既知の26アミノ酸配列の中で、このような高度な保存はいくつかのタンパク質でしか観察されておらず、そのすべてがタンパク質生合成プロセスに関与していることが知られています。明確な機能はまだタンパク質S19に割り当てられていませんが、これらの2つの真正細胞におけるその高い配列保存は、リボソーム機能のこのタンパク質の重要な役割を明確に示しています。

従来のオープンコラムクロマトグラフィーでは分離できなかったバチルスステアオザーモフィラス30Sリボソームサブユニットのいくつかのタンパク質は、半格闘的な逆位相C4カラムを使用して高性能液体クロマトグラフィーによって精製されました。タンパク質S19はこの手法によって精製され、完全なアミノ酸配列が決定されました。タンパク質S19を断片化し、ピコモール量で分離したペプチドを改善されたマニュアル4-N、N-ジメチルアミノアゾベンゼン-4'-イソチオシアネート(DABITC)技術によって配列決定しました。S19配列における5つの連続したC末端リジンの存在は、気相シーケンスと高速酸爆撃(FAB)質量分析によって確認されました。タンパク質S19は、10,428 Daの分子量に対応する91アミノ酸残基で構成されています。B. stearothermophilus S19配列の71%は、大腸菌[Yaguchi and Wittmann(1978)、Febs Lettの対応するリボソームタンパク質と同一であることがわかった。88、227]および両方のシーケンスは、ギャップなしで整列できます。B. stearothermophilusおよび大腸菌リボソームの既知の26アミノ酸配列の中で、このような高度な保存はいくつかのタンパク質でしか観察されておらず、そのすべてがタンパク質生合成プロセスに関与していることが知られています。明確な機能はまだタンパク質S19に割り当てられていませんが、これらの2つの真正細胞におけるその高い配列保存は、リボソーム機能のこのタンパク質の重要な役割を明確に示しています。

Several proteins from the Bacillus stearothermophilus 30S ribosomal subunit which could not be isolated by conventional open-column chromatography were purified by high-performance liquid chromatography using a semi-preparative reverse-phase C4 column. Protein S19 was purified by this technique and the complete amino acid sequence determined. Protein S19 was fragmented and the peptides isolated in picomole quantities were sequenced by an improved manual 4-N,N-dimethylaminoazobenzene-4'-isothiocyanate (DABITC) technique; the presence of five consecutive C-terminal lysines in the S19 sequence was confirmed by gas-phase sequencing and fast-atom-bombardment (FAB) mass spectrometry. Protein S19 is composed of 91 amino acid residues which correspond to a molecular mass of 10,428 Da. 71% of the B. stearothermophilus S19 sequence was found to be identical with the corresponding ribosomal protein from Escherichia coli [Yaguchi and Wittmann (1978), FEBS Lett. 88, 227] and both sequences can be aligned without gaps. Among the known 26 amino acid sequences of the B. stearothermophilus and E. coli ribosome such a high degree of conservation has only been observed for a few proteins, all of which are known to be involved in the protein biosynthesis process. Although a clear function has not yet been assigned to protein S19, its high sequence conservation in these two eubacteria clearly indicates an important role of this protein for the function of the ribosome.

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