DNA配列のメカニズム窒素マスタードによるグアニン-N7位置の選択的アルキル化

既知の配列のDNAフラグメントのさまざまなグアニンN7位置で、いくつかの窒素マスタードの相対反応速度から定量的測定が実行されました。調査結果は、反応選択性の起源の構造的仮説を示唆しています。エンドラベルDNA断片を窒素マスタードと反応させ、グアニンN7アルキル化部位をゲル電気泳動で分析しました。相対反応強度は、デジタル化された濃度計スキャンのコンピューター分析によって決定されました。異なるGでの反応強度の違いは、反応部位の近くの分子静電ポテンシャルに対する最近隣接塩基のペアの影響に部分的に起因していました。ウラシルとキナクリンのマスタードには、他のマスタードとは異なる反応に対する特定のシーケンスの好みがあります。特定のシーケンス選好の性質が決定され、その起源を説明するために仮説が提案されています。

Quantitative determinations were carried out of the relative reaction rates of several nitrogen mustards at various guanine-N7 positions in DNA fragments of known sequence. The findings suggest structural hypotheses of the origins of the reaction selectivities. End-labeled DNA fragments were reacted with nitrogen mustards, and the guanine-N7 alkylation sites were analyzed by gel electrophoresis. Relative reaction intensities were determined by computer analysis of digitized densitometer scans. The differences in reaction intensities at different G's were in part attributable to the effects of nearest neighbor base pairs on the molecular electrostatic potential near the reaction site. Uracil and quinacrine mustards have specific sequence preferences for reaction that differ from other mustards. The nature of the specific sequence preferences were determined and hypotheses are proposed to explain their origin.