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Expert review of proteomics2023Apr06Vol.issue()

データに依存しない獲得質量分析は、遺伝性トランスシレチンアミロイドーシス(ATTLV)患者の自然史における包括的な血漿タンパク質プロファイルを明らかにします

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文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

目的:遺伝性トランスシレチンアミロイドーシス(ATTRV)は、まれで致命的な常染色体優性疾患であり、140を超える変異が発見されました。アミロイド浸潤の3つの表現型は、神経障害(ATTRV-PN)、心障害(ATTRV-CM)、および神経障害 +心臓病(ATTRV-MIX)です。属性固有のバイオマーカーの欠如、生検の証拠の困難、および既知の病原性メカニズムが限られているため、診断が困難になりました。進行および疾患を修正する療法を監視するための新たに出現した非侵襲的対策により、早期診断と患者管理が改善されました。 方法:我々の研究では、遺伝性トランスシレチンアミロイドーシス(ATTV)の中国患者の自然史における包括的な血漿タンパク質プロファイルを明らかにするために、最新の技術データに依存しない買収ベースの定量的プロテオミクス(DIA)を適用しています。3つの表現型(attrv-pn、attrv-cm、およびattrv-mix)で差次的に発現したタンパク質(DEPS)を分析しました。 結果:合計18人の患者(6人のATTLV-PN、5人のATTRV-CM、および7人のATTRV-MIX患者)と20人の健康な参加者から対照群として血清サンプルを収集しました。プロテオームおよびバイオインフォマティック分析の結果と組み合わせて、ATTRV-PNとコントロールの間でKRTファミリータンパク質とDSC3にクラスター化された30のDEPとタンパク質相互作用ネットワークが見つかりました。小道。 結論:この研究は、ATTRVのさまざまな段階でグローバルかつ重要なプロテオームプロファイルを示しています。

目的:遺伝性トランスシレチンアミロイドーシス(ATTRV)は、まれで致命的な常染色体優性疾患であり、140を超える変異が発見されました。アミロイド浸潤の3つの表現型は、神経障害(ATTRV-PN)、心障害(ATTRV-CM)、および神経障害 +心臓病(ATTRV-MIX)です。属性固有のバイオマーカーの欠如、生検の証拠の困難、および既知の病原性メカニズムが限られているため、診断が困難になりました。進行および疾患を修正する療法を監視するための新たに出現した非侵襲的対策により、早期診断と患者管理が改善されました。 方法:我々の研究では、遺伝性トランスシレチンアミロイドーシス(ATTV)の中国患者の自然史における包括的な血漿タンパク質プロファイルを明らかにするために、最新の技術データに依存しない買収ベースの定量的プロテオミクス(DIA)を適用しています。3つの表現型(attrv-pn、attrv-cm、およびattrv-mix)で差次的に発現したタンパク質(DEPS)を分析しました。 結果:合計18人の患者(6人のATTLV-PN、5人のATTRV-CM、および7人のATTRV-MIX患者)と20人の健康な参加者から対照群として血清サンプルを収集しました。プロテオームおよびバイオインフォマティック分析の結果と組み合わせて、ATTRV-PNとコントロールの間でKRTファミリータンパク質とDSC3にクラスター化された30のDEPとタンパク質相互作用ネットワークが見つかりました。小道。 結論:この研究は、ATTRVのさまざまな段階でグローバルかつ重要なプロテオームプロファイルを示しています。

OBJECTIVES: Hereditary transthyretin amyloidosis (ATTRv) is a rare, fatal, autosomal dominant disease with more than 140 mutations discovered. Three phenotypes of amyloid infiltration are neuropathy (ATTRv-PN), cardiopathy (ATTRv-CM), and neuropathy + cardiopathy (ATTRv-MIX). The lack of ATTR-specific biomarkers, difficulties in biopsy evidence, and limited known pathogenic mechanisms have made diagnosis difficult. Newly emerging noninvasive measures for monitoring progression and disease-modifying therapies have improved early diagnosis and patient management. METHODS: Our research applies the latest technology, Data-Independent Acquisition-Based Quantitative Proteomics (DIA), to reveal comprehensive plasma protein profiles in the natural history of Chinese patients with hereditary transthyretin amyloidosis (ATTRv). We analyzed differentially expressed proteins (DEPs) in three phenotypes (ATTRv-PN, ATTRv-CM, and ATTRv-MIX). RESULTS: Serum samples were collected from a total of 18 patients (6 ATTRv-PN, 5 ATTRv-CM, and 7 ATTRv-MIX patients) and 20 healthy participants as a control group. Combined with the results of the proteomic and bioinformatic analyses, we found 30 DEPs and protein interaction networks clustered in KRT family proteins and DSC3 between ATTRv-PN and the control, which were rich in the estrogen signaling pathway and the cell adhesion molecule (CAM) pathway. CONCLUSION: This study demonstrates a global and significant proteomic profile in different stages of ATTRv.

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