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タイプ1の自然リンパ細胞（ILC1）に属する自然キラー（NK）細胞は、微生物感染症と戦うだけでなく、抗腫瘍反応においても重要な役割を果たします。肝細胞癌（HCC）は炎症関連の悪性腫瘍を表し、NK細胞は肝臓に濃縮されており、HCC免疫微小環境の重要な成分になっています。この研究では、単一細胞RNAシーケンス（SCRNA-seq）分析を実施して、NK細胞マーカー遺伝子（NKG）を特定し、TCGA-LIHCデータセットによって80の予後関連の遺伝子を明らかにしました。予後NKGに基づいて、HCC患者は、異なる臨床結果を持つ2つのサブタイプに分類されました。その後、予後NKGのラッソコックスおよび段階的回帰分析を実施して、5遺伝子（UBB、CIRBP、GZMH、NUDC、およびNCL）予後シグネチャーNkscoreを確立しました。Nkscoreによって層別化された2つのリスクグループの異なる突然変異状態が包括的に特徴付けられました。その上、確立されたNKSCORE統合ノモグラムは、予測パフォーマンスの強化を提示しました。単一サンプル遺伝子セット濃縮分析（SSGSEA）分析を使用して、腫瘍免疫微小環境（時間）の景観を明らかにし、高ナクシーリスクグループは免疫排除表現型で特徴付けられましたが、低ナクスコアリスクグループは比較的強力な反抗抗抗抗体を保持しています - キャンサー免疫。T細胞受容体（TCR）レパートリー、腫瘍炎症シグネチャ（TIS）、および免疫フェノスコア（IPS）分析により、2つのNKSCOREリスクグループ間の免疫療法感受性の違いが明らかになりました。まとめると、HCC患者の予後と免疫療法の有効性を予測するために、新しいNK細胞関連の署名を開発しました。
タイプ1の自然リンパ細胞（ILC1）に属する自然キラー（NK）細胞は、微生物感染症と戦うだけでなく、抗腫瘍反応においても重要な役割を果たします。肝細胞癌（HCC）は炎症関連の悪性腫瘍を表し、NK細胞は肝臓に濃縮されており、HCC免疫微小環境の重要な成分になっています。この研究では、単一細胞RNAシーケンス（SCRNA-seq）分析を実施して、NK細胞マーカー遺伝子（NKG）を特定し、TCGA-LIHCデータセットによって80の予後関連の遺伝子を明らかにしました。予後NKGに基づいて、HCC患者は、異なる臨床結果を持つ2つのサブタイプに分類されました。その後、予後NKGのラッソコックスおよび段階的回帰分析を実施して、5遺伝子（UBB、CIRBP、GZMH、NUDC、およびNCL）予後シグネチャーNkscoreを確立しました。Nkscoreによって層別化された2つのリスクグループの異なる突然変異状態が包括的に特徴付けられました。その上、確立されたNKSCORE統合ノモグラムは、予測パフォーマンスの強化を提示しました。単一サンプル遺伝子セット濃縮分析（SSGSEA）分析を使用して、腫瘍免疫微小環境（時間）の景観を明らかにし、高ナクシーリスクグループは免疫排除表現型で特徴付けられましたが、低ナクスコアリスクグループは比較的強力な反抗抗抗抗体を保持しています - キャンサー免疫。T細胞受容体（TCR）レパートリー、腫瘍炎症シグネチャ（TIS）、および免疫フェノスコア（IPS）分析により、2つのNKSCOREリスクグループ間の免疫療法感受性の違いが明らかになりました。まとめると、HCC患者の予後と免疫療法の有効性を予測するために、新しいNK細胞関連の署名を開発しました。
Belonging to type 1 innate lymphoid cells (ILC1), natural killer (NK) cells play an important role not only in fighting microbial infections but also in anti-tumor response. Hepatocellular carcinoma (HCC) represents an inflammation-related malignancy and NK cells are enriched in the liver, making them an essential component of the HCC immune microenvironment. In this study, we performed single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq) analysis to identify the NK cell marker genes (NKGs) and uncovered 80 prognosis-related ones by the TCGA-LIHC dataset. Based on prognostic NKGs, HCC patients were categorized into two subtypes with distinct clinical outcomes. Subsequently, we conducted LASSO-COX and stepwise regression analysis on prognostic NKGs to establish a five-gene (UBB, CIRBP, GZMH, NUDC, and NCL) prognostic signature-NKscore. Different mutation statuses of the two risk groups stratified by NKscore were comprehensively characterized. Besides, the established NKscore-integrated nomogram presented enhanced predictive performance. Single sample gene set enrichment analysis (ssGSEA) analysis was used to uncover the landscape of the tumor immune microenvironment (TIME) and the high-NKscore risk group was characterized with an immune-exhausted phenotype while the low-NKscore risk group held relatively strong anti-cancer immunity. T cell receptor (TCR) repertoire, tumor inflammation signature (TIS), and Immunophenoscore (IPS) analyses revealed differences in immunotherapy sensitivity between the two NKscore risk groups. Taken together, we developed a novel NK cell-related signature to predict the prognosis and immunotherapy efficacy for HCC patients.
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