Bradyrhizobium liaoningensensとBradyrhizobium ottawaenseが支配するユニークな根粒菌コミュニティは、日本の大阪県の野菜大豆結節で発見されました

野菜大豆（グリシンマックス[L.]）は主にアジア諸国で消費されていますが、栄養価が高いため、最近世界中で注目を集めています。私たちは、大阪県ヤオ市の野菜大豆の土着の根茎を特定し、根粒菌群集と土壌環境要因との関係を明確にすることを目指しました。土壌サンプルは、さまざまな種類の植物大豆を持つヤオ市の2つの異なる条件（6つの温室と6つのオープンフィールド）の下で、12の植物大豆栽培フィールドから収集されました。結節から合計217個の分離株が得られ、16S-23S RRNA内部転写スペーサー（ITS）領域に基づいて97％の相同性を持つ9つの運用分類単位（OTU）にクラスター化されました。系統発生的なアナリシスは、OTUSがBradyrhizobium liaoningense、B。Ottawaense、B。Elkanii、およびその他のBradyrhizobium種と密接に関連しており、この順序で支配的であることを示しました。B. liaoningenseはサンプリングされたサイトで広く発見され、すべての分離株の50.7％を占めていましたが、B。ottawaenseはほとんどがオープンフィールドに限定されていました。この根粒菌のコミュニティは、B。diazoefficiens、B。japonicum、およびB. elkaniiが支配的である日本の大豆根粒菌とは異なりました。これらの結果は、宿主植物または地域の専門分野間の特徴的な違いを意味します。非メトリック多次元スケーリング（NMDS）ANA-LYSISは、根茎の分布に対する土壌pHとCa、Mg、Mn、総窒素（TN）、および総炭素（TC）の含有量の有意な影響を明らかにしました。B. liaoningensensは、中性pHの土壌で検出され、高いTNと低MNの含有量がその存在量を増加させました。本研究は、日本の根茎に関する新しい洞察と、持続可能な農業のための潜在的に新しい資源を提供しています。

Vegetable soybean (Glycine max [L.]) is mainly consumed in Asian countries, but has recently attracted attention worldwide due to its high nutritional value. We aimed to identify the indigenous rhizobia of vegetable soybean in Yao City, Osaka Prefecture, Japan, and to clarify the relationships between the rhizobial community and soil environmental factors. Soil samples were collected from 12 vegetable soybean cultivation fields under two different conditions (six greenhouses and six open fields) in Yao City with different varieties of vegetable soybean. A total of 217 isolates were obtained from the nodules and clustered into nine operational taxonomic units (OTUs) with 97% homology based on the 16S-23S rRNA internal transcribed spacer (ITS) region. A phylogenetic ana-lysis showed that OTUs were closely related to Bradyrhizobium liaoningense, B. ottawaense, B. elkanii, and other Bradyrhizobium species and were dominant in this order. B. liaoningense was widely found in sampled sites and accounted for 50.7% of all isolates, while B. ottawaense was mostly limited to open fields. This rhizobial community differed from Japanese soybean rhizobia, in which B. diazoefficiens, B. japonicum, and B. elkanii were dominant. These results imply the characteristic differences among host plants or regional specialties. A non-metric multidimensional scaling (NMDS) ana-lysis revealed the significant impact of soil pH and the contents of Ca, Mg, Mn, total nitrogen (TN), and total carbon (TC) on the distribution of rhizobia. B. liaoningense was detected in soils with a neutral pH, and high TN and low Mn contents increased its abundance. The present study provides novel insights into Japanese rhizobia and potentially novel resources for sustainable agriculture.