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高温によって引き起こされる損傷は、米の生産に影響を与える最も重要な非生物的ストレスの1つです。米の生殖段階は、高温に非常に敏感です。現在の調査は、熱耐性に関連する多型マイクロサテライトマーカー(SSR)を特定するために行われました。米品種のnerica-l 44(熱耐性)およびUMA(熱感受性)を交差させて、F1およびF2の集団を生成しました。F2集団は38°Cを超えて熱ストレスにさらされ、144のF2植物がその耐性について評価されました。結果は、F2集団の平均は、植物の高さ、膜安定性指数、光合成速度、気孔コンダクタンス、蒸発散速度、花粉の生存率、スパイクレットの肥沃度、1000粒重量の特性に関して、耐性親の影響を受けたことに注意してください。スパイクレットの肥沃度の割合に基づいて、非常に敏感で耐性のある植物のそれぞれが選択されました。それらのDNAを耐性のある影響を受けやすいバルクにプールし、100個のSSRマーカーを使用して多型をチェックするために100個のSSRマーカーを使用して実行されました。調査では、親の間で18%の多型が明らかになりました。RM337、RM10793、RM242、RM5749、RM6100、RM490、RM470、RM473、RM222、およびRM556は、親と大ブクの間で多形性であることがわかった顕著なマーカーの一部です。特定された多型マーカーの遺伝子注釈と濃縮分析を実行しました。結果は、その染色体の配列固有の部位が、代謝経路、分子メカニズム、細胞内機能などの生物学的プロセスで主に濃縮されることを明らかにしました。その中で、RM337が熱耐性のために新たに報告されたマーカーでした。2つの遺伝子の発現分析は、RM337に対応しており、LOP1(loc_os08g01330)がイネの高温耐性に関連していることが明らかになりました。結果は、SSRマーカーを使用したBSAが熱耐性に寄与するゲノム領域を特定するのに役立つことを示しています。
高温によって引き起こされる損傷は、米の生産に影響を与える最も重要な非生物的ストレスの1つです。米の生殖段階は、高温に非常に敏感です。現在の調査は、熱耐性に関連する多型マイクロサテライトマーカー(SSR)を特定するために行われました。米品種のnerica-l 44(熱耐性)およびUMA(熱感受性)を交差させて、F1およびF2の集団を生成しました。F2集団は38°Cを超えて熱ストレスにさらされ、144のF2植物がその耐性について評価されました。結果は、F2集団の平均は、植物の高さ、膜安定性指数、光合成速度、気孔コンダクタンス、蒸発散速度、花粉の生存率、スパイクレットの肥沃度、1000粒重量の特性に関して、耐性親の影響を受けたことに注意してください。スパイクレットの肥沃度の割合に基づいて、非常に敏感で耐性のある植物のそれぞれが選択されました。それらのDNAを耐性のある影響を受けやすいバルクにプールし、100個のSSRマーカーを使用して多型をチェックするために100個のSSRマーカーを使用して実行されました。調査では、親の間で18%の多型が明らかになりました。RM337、RM10793、RM242、RM5749、RM6100、RM490、RM470、RM473、RM222、およびRM556は、親と大ブクの間で多形性であることがわかった顕著なマーカーの一部です。特定された多型マーカーの遺伝子注釈と濃縮分析を実行しました。結果は、その染色体の配列固有の部位が、代謝経路、分子メカニズム、細胞内機能などの生物学的プロセスで主に濃縮されることを明らかにしました。その中で、RM337が熱耐性のために新たに報告されたマーカーでした。2つの遺伝子の発現分析は、RM337に対応しており、LOP1(loc_os08g01330)がイネの高温耐性に関連していることが明らかになりました。結果は、SSRマーカーを使用したBSAが熱耐性に寄与するゲノム領域を特定するのに役立つことを示しています。
The damage caused by high temperature is one of the most important abiotic stress affecting rice production. Reproductive stage of rice is highly susceptible to high temperature. The present investigation was undertaken to identify polymorphic microsatellite markers (SSR) associated with heat tolerance. The rice cultivars NERICA- L 44 (heat tolerant) and Uma (heat susceptible) were crossed to generate F1 and F2 populations. The F2 population was subjected to heat stress at >38°C and the 144 F2 plants were evaluated for their tolerance. The results note that the mean of the F2 population was influenced by the tolerant parent with regards to the traits of plant height, membrane stability index, photosynthetic rate, stomatal conductance, evapotranspiration rate, pollen viability, spikelet fertility and 1000 grain weight. Ten each of the extremely susceptible and tolerant plants were selected based on the spikelet fertility percentage. Their DNA was pooled into tolerant and susceptible bulks and Bulked Segregant Analysis (BSA) was carried out using 100 SSR markers to check for polymorphism. The survey revealed a polymorphism of 18% between the parents. RM337, RM10793, RM242, RM5749, RM6100, RM490, RM470, RM473, RM222 and RM556 are some of the prominent markers that were found to be polymorphic between the parents and the bulks. We performed gene annotation and enrichment analysis of identified polymorphic markers. Result revealed that the sequence specific site of that chromosome mostly enriched with biological processes like metabolic pathway, molecular mechanism, and subcellular function. Among that RM337 was newly reported marker for heat tolerance. Expression analysis of two genes corresponds to RM337 revealed that LOP1 (LOC_Os08g01330) was linked to high temperature tolerance in rice. The results demonstrate that BSA using SSR markers is useful in identifying genomic regions that contribute to thermotolerance.
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