根系網膜剥離患者からの硝子体の4Dフリープロテオーム分析

目的：RRDの診断と治療においてバイオマーカーとして使用するために、葉状網膜剥離（RRD）の病因に関与する代謝産物、タンパク質、および関連する経路を特定します。 方法：硝子体標本を収集し、液体クロマトグラフィータンデム質量分析分析を4次元のラベルフリー技術を使用して実行しました。統計的に有意に発現したタンパク質、遺伝子オントロジー（GO）用語、京都百科事典（KEGG）経路表現、およびタンパク質相互作用が分析されました。 結果：9つの標本がプロテオーム解析にさらされました。合計で、53の上方制御タンパク質と108のダウンレギュレートされたタンパク質を含む、161のタンパク質が差次的に発現したタンパク質（DEPS）として同定されました。GO機能分析により、一部のDEPがニューロン関連の用語と膜タンパク質の用語で豊富であることが明らかになりました。さらに、KEGG分析は、細胞接着分子代謝経路がDEPの最大数と関連していることを示しました。最後に、タンパク質間相互作用ネットワークの評価により、DEPは神経癒着、アポトーシス、炎症および免疫応答、正しいタンパク質の折りたたみ、および解糖にクラスター化されていることが明らかになりました。 結論：プロテオームプロファイリングは、RRDの根底にある分子メカニズムの調査に役立ちます。この研究では、RRDの熱ショックタンパク質含有量、解糖、炎症反応に関連するタンパク質の発現レベルの増加が明らかになりました。RRD病因のバイオマーカーに関する知識は、将来のRRDの発生を防ぐのに役立つかもしれません。

AIM: To identify metabolites, proteins, and related pathways involved in the etiology of rhegmatogenous retinal detachment (RRD) for use as biomarkers in diagnosing and treating RRD. METHODS: Vitreous specimens were collected and liquid chromatography-tandem mass spectrometry analysis was performed using the four-dimensional label-free technique. Statistically significant differentially expressed proteins, gene ontology (GO) terms, Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway representations, and protein interactions were analyzed. RESULTS: Nine specimens were subjected to proteomic analysis. In total, 161 proteins were identified as differentially expressed proteins (DEPs), including 53 upregulated proteins and 108 downregulated proteins. GO functional analysis revealed that some DEPs were enriched in neuron-related terms and membrane protein terms. Moreover, KEGG analysis indicated that the cell adhesion molecule metabolic pathway was associated with the greatest number of DEPs. Finally, the evaluation of protein-protein interaction network revealed that DEPs were clustered in neuronal adhesion, apoptosis, inflammation and immune responses, correct protein folding, and glycolysis. CONCLUSION: Proteomic profiling is useful for the exploration of molecular mechanisms that underlie RRD. This study reveals increased expression levels of proteins related to heat shock protein content, glycolysis, and inflammatory responses in RRD. Knowledge regarding biomarkers of RRD pathogenesis may help to prevent the occurrence of RRD in the future.