アリル炭結合阻害剤は、グリコシドヒドロラーゼを共有結合して結合します

アリルシクリトールは、化学、酵素、プロテオーム、および計算方法により、グリコシドヒドロラーゼの共有結合阻害剤として調査されました。このアプローチは、4位（炭水化物番号）で潜在的な炭水化物を去る群を特徴とするC7シクリトール天然産物ストレプトールグルコシドに触発されました。この仮説をテストするために、4および6位置にグループを残す炭素環型阻害剤を準備しました。酵素動態分析の結果は、ジニトロフェニルエーテルが再活性化なしでGH13ファミリーのα-グルコシダーゼを共有結合することを実証しました。標識された酵素はプロテオミクスによって研究され、活性部位残基ASP214は修飾として同定されました。さらに、酵素相同性モデリングと密度汎関数理論（DFT）計算を含む計算研究により、活動の電子的および構造的要件がさらに描かれています。この研究は、阻害剤設計を成功させるために、以前に未開拓の4位および6位が悪用される可能性があることを示しています。

Allylic cyclitols were investigated as covalent inhibitors of glycoside hydrolases by chemical, enzymatic, proteomic, and computational methods. This approach was inspired by the C7 cyclitol natural product streptol glucoside, which features a potential carbohydrate leaving group in the 4-position (carbohydrate numbering). To test this hypothesis, carbocyclic inhibitors with leaving groups in the 4- and 6- positions were prepared. The results of enzyme kinetics analyses demonstrated that dinitrophenyl ethers covalently inhibit α-glucosidases of the GH13 family without reactivation. The labeled enzyme was studied by proteomics, and the active site residue Asp214 was identified as modified. Additionally, computational studies, including enzyme homology modeling and density functional theory (DFT) calculations, further delineate the electronic and structural requirements for activity. This study demonstrates that previously unexplored 4- and 6-positions can be exploited for successful inhibitor design.