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PeerJ20230101Vol.11issue()

皮膚黒色腫患者の潜在的なバイオマーカーとしての滅菌A-Motifドメイン含有9様の同定

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文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

皮膚皮膚黒色腫(SKCM)は、最も攻撃的な悪性腫瘍の1つであり、年間皮膚がん関連の死亡者の約75%を占めています。滅菌A-Motifドメイン含有9様(SAMD9L)は、細胞の増殖を調節し、腫瘍性表現型を抑制することがわかっていますが、SKCMにおけるその特定の役割は不明のままです。SKCMの癌関連免疫学と腫瘍の進行におけるSAMD9Lの役割を調査するために、SKCMでのSAMD9Lの発現レベルの上昇を明らかにした統合バイオインフォマティクス分析を実施しました。ROC曲線と生存分析により、SAMD9Lのかなりの診断および予後能力が確認されました。さらに、Soochow大学の最初の関連病院の35人のSKCM患者の実世界のコホートは、SAMD9Lのより高い発現レベルが予後の改善と関連していることを示しました。細胞培養、レンチウイルストランスフェクトSKCM細胞株の生成、細胞増殖アッセイ、およびTranswellアッセイなどの検証実験を実施しました。さらに、SAMD9L発現は免疫浸潤に強く関連していることがわかりました。我々の結果は、SAMD9LとXAF1発現の間に正の相関があることを明らかにし、SAMD9Lが共発現XAF1遺伝子を使用したSKCMの前向き予後指標として機能する可能性があることを示唆しています。要約すると、我々の調査結果は、SAMD9Lが予後の有望で治療的なバイオマーカーとして機能し、SKCMにおける腫瘍免疫相互作用において重要な役割を果たす可能性があることを示しています。

皮膚皮膚黒色腫(SKCM)は、最も攻撃的な悪性腫瘍の1つであり、年間皮膚がん関連の死亡者の約75%を占めています。滅菌A-Motifドメイン含有9様(SAMD9L)は、細胞の増殖を調節し、腫瘍性表現型を抑制することがわかっていますが、SKCMにおけるその特定の役割は不明のままです。SKCMの癌関連免疫学と腫瘍の進行におけるSAMD9Lの役割を調査するために、SKCMでのSAMD9Lの発現レベルの上昇を明らかにした統合バイオインフォマティクス分析を実施しました。ROC曲線と生存分析により、SAMD9Lのかなりの診断および予後能力が確認されました。さらに、Soochow大学の最初の関連病院の35人のSKCM患者の実世界のコホートは、SAMD9Lのより高い発現レベルが予後の改善と関連していることを示しました。細胞培養、レンチウイルストランスフェクトSKCM細胞株の生成、細胞増殖アッセイ、およびTranswellアッセイなどの検証実験を実施しました。さらに、SAMD9L発現は免疫浸潤に強く関連していることがわかりました。我々の結果は、SAMD9LとXAF1発現の間に正の相関があることを明らかにし、SAMD9Lが共発現XAF1遺伝子を使用したSKCMの前向き予後指標として機能する可能性があることを示唆しています。要約すると、我々の調査結果は、SAMD9Lが予後の有望で治療的なバイオマーカーとして機能し、SKCMにおける腫瘍免疫相互作用において重要な役割を果たす可能性があることを示しています。

Skin cutaneous melanoma (SKCM) is one of the most aggressive malignancies, accounting for approximately 75% of skin cancer-related fatalities annually. Sterile a-motif domain-containing 9-like (SAMD9L) has been found to regulate cell proliferation and suppress the neoplastic phenotype, but its specific role in SKCM remains unknown. To investigate the cancer-associated immunology of SKCM and the role of SAMD9L in tumor progression, we conducted an integrative bioinformatics analysis that revealed elevated expression levels of SAMD9L in SKCM. ROC curves and survival analyses confirmed the considerable diagnostic and prognostic abilities of SAMD9L. Moreover, a real-world cohort of 35 SKCM patients from the First Affiliated Hospital of Soochow University showed that higher expression levels of SAMD9L were associated with better prognosis. We performed validation experiments, including cell culture, generation of lentiviral-transfected SKCM cell lines, cell proliferation assay, and transwell assay, which demonstrated that down-regulation of SAMD9L significantly promoted proliferation and migration capacities of SKCM cells. Additionally, SAMD9L expression was found to be strongly linked to immune infiltration. Our results revealed a positive correlation between SAMD9L and XAF1 expression, suggesting that SAMD9L may serve as a prospective prognostic indicator of SKCM with co-expressed XAF1 gene. In summary, our findings indicate that SAMD9L may serve as a promising prognostic and therapeutic biomarker and play a critical role in tumor-immune interactions in SKCM.

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