oppheatmap：OMICSデータ用のさまざまな種類のヒートマップをレンダリングする

ヒートマップは、ハイスループットのOMICSデータから高次元情報を表示するための生物学者が好む視覚化モードです。ウェブサイトサービスやRパッケージを含む多くのソフトウェアを使用して、さまざまな種類のカスタマイズされたヒートマップを生成します。ここでは、MATLABを介してさまざまな種類のヒートマップをレンダリングするために構築された新しいツールであるOppheatMap（HeatMapのOMICSパイロットプラットフォーム）について説明します。OppheatMapは、通常のヒートマップ、階層的クラスタリング、Treemap、マイクロプレートグラフ、サンプル相関（フルヒートマップおよび上下の三角形の部分）、遺伝子相関（列またはテーブル間）、および極地ヒートマップをプロットするために利用できます。oppheatmapは、境界、フォント、色の変更をサポートして、最終プロットをカスタマイズします。OppheatMapは、Microsoft Excelのデータを読み取って特定のヒートマップを生成するだけでなく、各セルをExcelで色付けすることでExcelヒートマップを作成できます。グラフは、SVG（サポートされているベクトルグラフ）形式で保存し、他のSVG認識ソフトウェアによって変更できます。OppheatMapは、GUI（グラフィカルユーザーインターフェイス）操作を備えたMatlab AppDesignerによって設計されています。OppheatMapのプログラムは、https：//github.com/hangzhousheep/oppheatmapで入手できました。

Heatmaps are preferred visualization modes for biologists to display high-dimensional information from high-throughput omics data. Many software including website services and R packages are available to generate various types of customized heatmaps. Here, we describe oppHeatmap (omics pilot platform of heatmap), a new tool constructed to render different kinds of heatmaps through MATLAB. oppHeatmap is available for plotting ordinary heatmaps, hierarchical clustering, TreeMaps, microplates graph, sample correlation (full heatmap and upper and lower triangle parts), gene correlation (between columns or tables), and polar heatmaps. oppHeatmap can support the modification of borders, fonts, and colors to customize the final plots. oppHeatmap can not only read data from Microsoft Excel to generate specific heatmaps but also make Excel heatmaps by coloring each cell in Excel. The graphs can be stored in SVG (supported vector graph) format and modified by other SVG recognition software. oppHeatmap is designed by MATLAB AppDesigner with GUI (graphical user interface) operation. The program for oppHeatmap was available at https://github.com/HangZhouSheep/oppHeatmap .are diagramed by.